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DNA条形码技术鉴定贝母属植物
引用本文:俞超,梁孝祺,陈金金,盛梦俊,冯亚斌,王忠华.DNA条形码技术鉴定贝母属植物[J].中草药,2014,45(11):1613-1619.
作者姓名:俞超  梁孝祺  陈金金  盛梦俊  冯亚斌  王忠华
作者单位:浙江万里学院 生物技术研究所, 浙江 宁波 315100;浙江万里学院 生物技术研究所, 浙江 宁波 315100;浙江万里学院 生物技术研究所, 浙江 宁波 315100;浙江万里学院 生物技术研究所, 浙江 宁波 315100;浙江万里学院 生物技术研究所, 浙江 宁波 315100;浙江万里学院 生物技术研究所, 浙江 宁波 315100
基金项目:浙江省中药材育种专项资助(2012C12912);宁波市科技局择优委托项目资助(2012C10036);浙江万里学院重中之重学科自设课题项目资助(ZS2013006)
摘    要:目的 采用DNA条形码技术,比较了条形码序列ITS1和ITS2在贝母属植物中的鉴定效果。方法 从8个贝母属21个样品中提取了基因组DNA,进行ITS1、ITS2序列的PCR扩增和测序,并比较了各样品DNA提取率、PCR扩增率及测序成功率。测序数据采用BLAST搜索法评价2种序列的鉴定能力,采用SPSS软件进行遗传距离分析,采用MEGA软件进行系统发育树的构建。结果 对比不同物种ITS1、ITS2序列的一级结构差异,发现其ITS1序列长度为205~229 bp,有信息位点27个(所占比例11.8%),鉴定成功率为72.2%;ITS2序列长度为236~244 bp,有信息位点20个(所占比例8.2%),鉴定成功率为100%。ITS1序列的种内及种间遗传距离分别为0.001 8和0.066 1,而ITS2序列的种内及种间遗传距离分别为0.000 5和0.046 8,且种内高度保守;系统发育树构建结果显示,2种ITS序列能准确区分出浙贝母类群、川贝母类群和北方贝母类群,而ITS2序列所构建的系统发育树准确度更高。结论 ITS2 序列能够更准确鉴定不同物种贝母,适合作为贝母属植物的通用条形码序列。

关 键 词:贝母属  ITS1  ITS2  DNA条形码  分子鉴定
收稿时间:2013/10/22 0:00:00

Identification of plants in Fritillariae L. by DNA barcoding technology
YU Chao,LIANG Xiao-qi,CHEN Jin-jin,SHENG Meng-jun,FENG Ya-bin and WANG Zhong-hua.Identification of plants in Fritillariae L. by DNA barcoding technology[J].Chinese Traditional and Herbal Drugs,2014,45(11):1613-1619.
Authors:YU Chao  LIANG Xiao-qi  CHEN Jin-jin  SHENG Meng-jun  FENG Ya-bin and WANG Zhong-hua
Institution:Institute of Biotechnology, Zhejiang Wanli University, Ningbo 315100, China;Institute of Biotechnology, Zhejiang Wanli University, Ningbo 315100, China;Institute of Biotechnology, Zhejiang Wanli University, Ningbo 315100, China;Institute of Biotechnology, Zhejiang Wanli University, Ningbo 315100, China;Institute of Biotechnology, Zhejiang Wanli University, Ningbo 315100, China;Institute of Biotechnology, Zhejiang Wanli University, Ningbo 315100, China
Abstract:
Keywords:Fritillaria L    ITS1  ITS2  DNA barcoding  molecular  identification
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