| 基于Arlequin软件的HLA单倍型分析研究 |
| |
| 引用本文： | 刘悦越,贾双双,袁娟丽,杜加亮,陈红兵,国泰. 基于Arlequin软件的HLA单倍型分析研究[J]. 检验医学与临床, 2016, 0(13): 1752-1754. DOI: 10.3969/j.issn.1672-9455.2016.13.004 |
| |
| 作者姓名： | 刘悦越 贾双双 袁娟丽 杜加亮 陈红兵 国泰 |
| |
| 作者单位： | 1. 中国食品药品检定研究院,北京100050; 中国医学科学院/北京协和医学院医学生物学研究所,昆明650118;2. 中国医学科学院/北京协和医学院医学生物学研究所,昆明,650118;3. 南昌大学,南昌,330031;4. 中国食品药品检定研究院,北京,100050 |
| |
| 基金项目： | 国家科技重大专项课题资助项目(2012ZX10004702,2014ZX09304-316)。 |
| |
| 摘 要： | 目的应用Arlequin软件进行HLA单倍型的分析。方法将HLA-A和B两基因座位的等位基因分型数据进行格式转换,编辑成.arp格式输入文件,导入Arlequin软件进行分析计算。结果用Arlequin软件进行HLA单倍型分析,直接得出各单倍型及等位基因的频率和统计表,分析得出19种HLA-A等位基因、39种HLA-B等位基因和128种A-B单倍型。结论 Arlequin软件可用于HLA单倍型的计算,该方法具有简便、快速、广谱、可操作性强的特点。
|
| 关 键 词： | 人类白细胞抗原 单倍型 等位基因 基因多态性 |
Analysis of HLA haplotype by Arlequin software |
| |
| Abstract: | Objective To investigate haplotype frequencies of HLA using Arlequin software .Methods The genetic type data of alleles in human leukocyte antigen (HLA) A and B loci were transformed to the file with .arp .Then the HLA haplotypes were cal‐culated by Arlequin software .Results The frequencies of alleles and haplotypes were shown in table directly .A total of 19 HLA‐A alleles ,39 HLA‐B alleles and 128 HLA A‐B haplotypes were observed .Conclusion In conclusion ,the HLA haplotypes frequencies could be calculated by Arlequin software ,which is a simple ,convenient ,fast ,universal and operable way to analyze the haplotype . |
| |
| Keywords: | human leukocyte antigen haplotype alleles polymorphism |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
|
