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SMC基因家族在肝癌中的表达及其预测肝癌预后的临床意义
引用本文:霍励耘,魏英城,谭文亮,商昌珍,陈亚进.SMC基因家族在肝癌中的表达及其预测肝癌预后的临床意义[J].岭南现代临床外科,2021,21(1):24-28.
作者姓名:霍励耘  魏英城  谭文亮  商昌珍  陈亚进
作者单位:中山大学孙逸仙纪念医院肝胆外科,广州 510120
基金项目:国家自然科学基金(82072714,81972263);广东省自然科学基金(2018A030310118)。
摘    要:目的研究SMC基因家族在肝癌组织中的表达水平,及其与肝癌分期和预后的相关性。方法应用UALCAN和Human Protein Atlas数据库,分析SMC基因家族在肝癌组织和正常肝组织的表达水平,并进一步分析其在肝癌不同分期中的转录水平。利用GEPIA数据库完成对SMC家族各成员基因与肝癌的生存预后相关性分析。结果与正常肝组织比较,SMC基因家族成员在肝癌组织中高表达(肝癌vs.正常肝组织,P<0.0001),其转录水平也与肿瘤的分期有关。SMC1A、SMC1B、SMC2、SMC3、SMC4、SMC5和SMC6在Ⅲ期肝癌中的表达显著高于Ⅰ期肝癌(Ⅲ期vs.Ⅰ期,P<0.05),SMC1A和SMC2在Ⅱ期肝癌患者中的表达高于Ⅰ期肝癌(Ⅰ期vs.Ⅱ期,P<0.05)。此外,在肝癌的生存分析中显示,SMC1A、SMC2、SMC3、SMC4、SMC6高表达患者的预后较差(P<0.05),其总生存期(OS)或无瘤生存期(DFS)明显短于低表达组。结论SMC基因家族在肝癌组织中高表达,其中SMC1A、SMC2、SMC3、SMC4、SMC6的表达与肝癌患者预后不良呈正相关,可以作为肝癌预后预测因素。

关 键 词:SMC基因家族  肝癌  预后  生物信息学分析
收稿时间:2020-09-20

The clinical significance of SMC gene family in the diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma
HUO Li-yun,WEI Ying-cheng,TAN Wen-liang,SHANG Chang-zhen,CHEN Ya-jin.The clinical significance of SMC gene family in the diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma[J].Lingnan Modern Clinics in Surgery,2021,21(1):24-28.
Authors:HUO Li-yun  WEI Ying-cheng  TAN Wen-liang  SHANG Chang-zhen  CHEN Ya-jin
Institution:Department of Hepatobiliary Surgery, Sun Yat-sen Memorial Hospital, Sun Yat-sen, University, Guangzhou 510289, China
Abstract:
Keywords:SMC gene family  hepatocellular carcinoma  prognosis  bioinformatics analysis
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