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郑州市B19病毒分离株全基因的克隆及序列测定
引用本文:赵国强,宋建伟,戚敏,张世杰,陈宗德. 郑州市B19病毒分离株全基因的克隆及序列测定[J]. 郑州大学学报(医学版), 2005, 40(3): 385-387
作者姓名:赵国强  宋建伟  戚敏  张世杰  陈宗德
作者单位:郑州大学基础医学院微生物学与免疫学教研室,郑州,450052;郑州大学医学实验中心,郑州,450052;郑州大学基础医学院药理学教研室,郑州,450052
基金项目:河南省科技攻关基金资助项目01140512
摘    要:目的:克隆和测定在郑州市得到的B19病毒分离株全基因序列。方法:采用聚合酶链反应(PCR)技术从l例B19阳性的流产患者血清中分段扩增B19病毒全基因,获得7个互相重叠的片段,分别长814bp(1~814),849bp(753~1601),663bp(1523~2185),738bp(2124~2861),1011bp(2790~3800),1014bp(3747~4760),914bp(4681~5594)。将其分别克隆入T载体,进行测序分析。结果:郑州市B19病毒分离株全基因长5594个核苷酸,有3个开放读码框架(ORF)。第1个ORF位于615~2630位核苷酸,编码672个氨基酸,第2个ORF位于2623~4968位核苷酸,编码782个氨基酸,第3个ORF位于3304~4968位核苷酸,编码555个氨基酸。在该基因中4种碱基在基因组中所占比例为:A,29.58%(1655/5594),T,26.52%(1484/5594),G,22.88%(1280/5594),C,21.02%(1175/5594)。郑州B19病毒分离株基因序列与GenBank中NC_000883高度同源;存在10个碱基改变,只有1个引起氨基酸改变(3752位C→G导致Ser→Cys)。结论:郑州B19病毒分离株和NC_000883属同一基因型。

关 键 词:B19  聚合酶链反应  序列分析
修稿时间:2005-02-22

Cloning and sequencing of complete B19 virus genome from Zhengzhou specimen
ZHAO Guoqiang,Song Jianwei,QI Min,Zhang Shijie,CHEN Zongde. Cloning and sequencing of complete B19 virus genome from Zhengzhou specimen[J]. Journal of Zhengzhou University: Med Sci, 2005, 40(3): 385-387
Authors:ZHAO Guoqiang  Song Jianwei  QI Min  Zhang Shijie  CHEN Zongde
Affiliation:ZHAO Guoqiang 1),SONG Jianwei 2),QI Min 3),ZHANG Shijie 1),CHEN Zongde 1) 1)Department of Microbiology and Immunology,College of Basic Medical Sciences,Zhengzhou University,Zhengzhou 450052 2)Experimental Center of Medical College,Zhengzhou University,Zhengzhou 450052 3)Department of Pharmacology,College of Basic Medical Sciences,Zhengzhou University,Zhengzhou 450052
Abstract:
Keywords:B19  PCR  sequence analysis
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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