| 中国HIV-1 vpr基因多态性及其进化树的分析 |
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| 引用本文： | 刘猛,郑煜煌,何艳,陈霞,周华英,张春迎,谌资,郑力文.中国HIV-1 vpr基因多态性及其进化树的分析[J].中国医师杂志,2010,12(3):307-310. |
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| 作者姓名： | 刘猛 郑煜煌 何艳 陈霞 周华英 张春迎 谌资 郑力文 |
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| 作者单位： | 中南大学湘雅二医院传染科,长沙,410011 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目，教育部博士点基金资助项目 |
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| 摘 要： | 目的分析中国各地HIV-1感染者的vpr基因多态性，比较HIV-1 vpr基因变异的基本特征及其与国外以往研究的异同，为进一步探索HIV-1 vpr的致病机理及可能的基因治疗靶位打下基础。方法提取348例中国各地区HIV-1感染者血浆病毒RNA，运用逆转录聚合酶链式反应（RT—PCR）扩增HIV-1 vpr基因，凝胶电泳鉴定后行基因测序。用Blast、ClustalW、Mega4．0等相关生物分析软件进行vpr基因核苷酸和Vpr氨基酸序列分析，并构建进化树，分析中国HIV．1感染者的vpr基因的多态性、变异特征和亚型的分子流行病学特征。结果按vpr基因分型共发现AB、AE、BC、B、C5种HIV-1亚型，分别占2．60％，55．19％，2．60％，18．18％，21．43％，其中AE亚型比例最大。观察到Vpr氨基酸序列有9个变异率大于20％的位点。结论首次分析中国感染者的HIV-1vpr基因多态性及其基因进化树的特征，发现一些vpr变异率较大的氨基酸位点，这些Vpr氨基酸序列的变异与其致病能力的关系有待进一步研究。
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| 关 键 词： | vpr基因产物，人免疫缺陷病毒／遗传学 HIV感染／遗传学 多态现象，遗传 |
HIV-1 vpr gene diversity detection in China and its gene tree analysis |
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| LIU Meng,ZHENG Yu-huang,HE Yan,CHEN Xia,ZHOU Hua-ying,ZHANG Chun-ying,CHEN Zi,ZHENG Li-wen.HIV-1 vpr gene diversity detection in China and its gene tree analysis[J].Journal of Chinese Physician,2010,12(3):307-310. |
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| Authors: | LIU Meng ZHENG Yu-huang HE Yan CHEN Xia ZHOU Hua-ying ZHANG Chun-ying CHEN Zi ZHENG Li-wen |
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| Institution: | . (Department of Infectious Diseases, Xiangya Second Hospital, Central-south University, Changsha 410011, China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | vpr Gene Products human Immunedeficiency Virus/GE HIV Infections/GE Poly-morphism genetic |
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