中国人甲状腺乳头状癌中RET/PTC融合基因DNA序列特征的初步研究

目的应用长距离PER（long-distance PER，LD—PER），从甲状腺乳头状癌（papillary thyroid carcinoma，FTC）的基因组DNA中扩增RET／PTC1、3融合内含子，并分析融合点附近的DNA序列特征，探讨中国成人散发性PTC中RET／PTC融合基因的发生机理。方法20例新鲜FTC标本，用逆转录-PER方法检测RET／PTC基因的mRNA表达，确定阳性病例及融合基因类型后利用长距离PER扩增RET／PTC1和RET／PTC3的DNA片段。结果20例PTC新鲜组织中检测到RET／PTC1和RET／PTC3阳性病例各1例：（1）RET／PTC1融合基因的DNA片段大小为3091bp，融合点位于H4基因的第1内含子和RET基因的第11内含子。融合点呈端端吻合，无缺失、插入及重复序列等改变。（2）RET／PTC3（ELE1-RET）和交互性融合（reciprocal fusion）后形成的相应DNA片段（RET-ELE1），大小分别为2119bp和1568bp。RET／PTC3的融合点位于ELE1基因第5内含子的Alu序列内，在ELE1基因融合点上游有polyA序列。ELE1-RET的融合点的两个碱基（gg）无法判断来源于RET或ELE1基因。结合RET／PTC3与RET-ELE1，在融合点。ELE1基因有2个碱基（aa）缺失，RET基因有5个碱基（gttcc）缺失。结论Alu序列可能参与了RET／PTC3融合基因的形成。对于研究FTC中RET／PTC融合点附近的DNA序列特征及融合形成的机制，长距离PER是一种可行性比较高的研究方法。