基于网络药理学-分子对接技术研究柴胡治疗卒中后抑郁的药效物质基础及作用机制 |
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引用本文: | 吴雪梅,龚丽,陈春艳,刘顶鼎.基于网络药理学-分子对接技术研究柴胡治疗卒中后抑郁的药效物质基础及作用机制[J].中医临床研究,2024(4):1-8. |
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作者姓名: | 吴雪梅 龚丽 陈春艳 刘顶鼎 |
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作者单位: | 1. 贵州中医药大学第一附属医院;2. 贵州中医药大学 |
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基金项目: | 贵州省科技计划项目(黔科合支撑[2021]一般019); |
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摘 要: | 目的:通过网络药理学和分子对接技术,探讨柴胡治疗卒中后抑郁(Post-stroke Depression, PSD)的潜在活性成分和可能的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和蛋白质序列数据库(Uniprot)筛选出柴胡主要活性成分及其靶点基因,并将目标蛋白名称标准化,通过GeneCards、OMIM数据库获取PSD靶点基因;对两者靶点取交集后采用STRING数据库构建柴胡治疗PSD的潜在靶点的蛋白质-蛋白质相互作用网络图;利用Cytoscape-v3.9.1软件进行核心靶点筛选;利用DAVID数据库对潜在靶点进行基因本体(GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。最后,利用PyMol软件和AutoDockTools-1.5.7软件对柴胡主要活性成分与核心靶点使用分子对接技术绘制相应的分子对接图。结果:共筛选得到柴胡活性成分17个,去重后对应靶点175个,疾病靶点852个,经Venny数据库预测到疾病-药物交集靶点45个。GO功能富集分析结果显示共获得323个GO功能注释,KEGG通路富集分析结果显示获得106条信号通路。分子对接...
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关 键 词: | 卒中后抑郁 柴胡 网络药理学 分子对接 机制 |
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