基于蛋白质组学的慢性阻塞性肺疾病合并肺癌的关键靶点筛选与验证

目的 采用蛋白质组学分析联合生物信息学技术，初步预测慢性阻塞性肺疾病(COPD)相关肺癌(COPD-LC)的生物学机制及其潜在的核心治疗靶点，并进行验证。方法 收集2018年12月至2021年8月新疆医科大学第四临床医学院门诊就诊的COPD、肺癌患者以及体检的健康人员的尿液标本，并进行高通量测序。筛选差异蛋白并构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络图，进行功能富集分析，进一步预测COPD-LC的关键靶点，最后采用基因表达数据库(GEO)对上述分子进行验证。结果 蛋白质组学结果显示，与正常对照组相比，COPD组存在157个差异蛋白，其中上调67个，下调90个；与正常对照组相比，肺癌组存在306个差异蛋白，其中上调132个，下调174个；此外，本研究基于相互作用基因检索工具(STRING)平台，将上述差异蛋白进行PPI分析。基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析结果显示，COPD-LC主要富集在细胞外区域、溶酶体、细胞外空间、淀粉酶活性、蛋白酶抑制剂活性、防御/免疫蛋白活性等方面。在GEO数据库中搜索关于COPD和肺癌患者微阵列数据，最终纳入GSE8581和GSE4334...