| 基因表达与基因功能的关联分析 |
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| 引用本文： | 徐娜,吕飒丽,李霞,郭政,杜磊,宫滨生. 基因表达与基因功能的关联分析[J]. 生物医学工程学杂志, 2007, 24(2): 385-388 |
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| 作者姓名： | 徐娜 吕飒丽 李霞 郭政 杜磊 宫滨生 |
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| 作者单位： | 哈尔滨医科大学,生物信息学系,哈尔滨,150086 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金;国家高技术研究发展计划(863计划);黑龙江省科技攻关项目;黑龙江省卫生厅科研项目;国家"211"工程建设项目 |
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| 摘 要： | 利用基因在KEGG中的通路信息和LocusLink中的染色体位置信息,同时使用三种相似性测度对在通路上功能相关且在染色体上位置相近基因的表达进行了分析,得到以下结果;(1)通路上功能相关(通路距离相近)且染色体位置相近的基因在mRNA水平上的表达是相似的。(2)当基因在通路上的功能相关性越大或者与通路功能相关的基因在染色体上的位置越接近时,基因的表达也越相似,并且相似性程度加强。以上结果表明,功能相关与表达相似具有一定的关联性。
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| 关 键 词： | 功能相关性 表达相似性 通路 染色体位置 |
| 修稿时间： | 2004-05-102005-03-01 |
Association Analysis of Gene Expression and Gene Function |
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| Xu Na,Lü Sali,Li Xia,Guo Zheng,Du Lei,Gong Binsheng. Association Analysis of Gene Expression and Gene Function[J]. Journal of biomedical engineering, 2007, 24(2): 385-388 |
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| Authors: | Xu Na Lü Sali Li Xia Guo Zheng Du Lei Gong Binsheng |
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| Affiliation: | Department of Bioinformatics,Harbin Medical University, Harbin 150086,China |
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| Abstract: | The pathway information in KEGG and the chromosome location in LocusLink, and three different similarity measurements are used to analyze the similarity of the mRNA expression level of genes which have strong correlative function with each other in a pathway and have near location with each other in the chromosome. The results are summarized as follows:(1) Quite a number of genes show significant correlation with other correlative genes at mRNA expression level. (2) The mRNA expression level is consistent with the intensity of functional relationships between genes. So it can be concluded that the function of genes involved in any pathway is correlated with the mRNA expression level of genes. |
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| Keywords: | Functional correlation Expression similarity Pathway Chromosome location |
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