| GeneSifter在基因表达谱芯片数据挖掘中的应用 |
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| 引用本文： | 廖之君,马文丽,梁爽,郑文岭. GeneSifter在基因表达谱芯片数据挖掘中的应用[J]. 医学信息, 2007, 20(11): 1882-1887 |
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| 作者姓名： | 廖之君 马文丽 梁爽 郑文岭 |
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| 作者单位： | [1]南方医科大学基因工程研究所,广东广州510515 [2]福建医科大学生物化学与分子生物学系,福建福州350004 [3]华南基因组研究中心,广东广州510800 |
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| 摘 要： | 介绍一款基因芯片数据分析工具——GeneSifter软件。具有快速、直观、便捷等特点，尤其适用于基因表达谱的数据挖掘。芯片数据一般以格式化文本文档形式上载，根据实验目的、设计不同，总共有4种上载向导工具，数据分析从控制台Analysis项目下的Pairwise或Projects进入，需要设置滤过、阈值和统计分析等参数，Pairwise可获得的结果有：差异显著性基因列表、基因本体报告和KEGG通路报告等，Projects有更为强大的功能，可获取聚类等6种结果。GeneSifter独特的一站式单击设置，可获得相关基因的11个数据库最新链接。GeneSifcer适用于基因芯片数据挖掘的生物研究人员。
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| 关 键 词： | GeneSifter软件 数据挖掘 基因本体术语 KEGG通路 聚类 |
| 收稿时间： | 2007-08-20 |
| 修稿时间： | 2007-08-20 |
Application of GeneSifter Software for Data Mining of Gene Expression Profiling |
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| LIAO Zhi-jun,MA Wen-li,LIANG Shuang,ZHENG Wen-ling. Application of GeneSifter Software for Data Mining of Gene Expression Profiling[J]. Medical Information, 2007, 20(11): 1882-1887 |
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| Authors: | LIAO Zhi-jun MA Wen-li LIANG Shuang ZHENG Wen-ling |
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| Affiliation: | Institute of Genetic Engineering, Southern Medical University, Guangzhou 510515, China;Department of biochemistry and molecular biology, Fujian Medical University, Fuzhou 350004, China; South China Genomies Research Center, Guangzhou 510800, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | GeneSifter Software Data Mining Gene Ontology Term KEGG Pathway Cluster |
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