肝细胞癌组织中TRM细胞相关基因的生物信息学分析及功能预测

目的 应用生物信息学技术分析肝细胞癌(HCC)中组织驻留记忆性T细胞(T_RM细胞)的免疫学特性，并分析相关关键基因及其影响的免疫通路。方法 从公共数据库平台——癌症基因组图谱(TCGA)下载HCC相关的基因芯片数据，应用单样本基因集富集分析(ssGSEA)对T_RM细胞的关键标记基因表达数据进行评分，获得T_RM评分，根据T_RM评分的最佳截断值分为2组；应用Wilcoxon差异分析获得HCC组织中T_RM细胞高度相关的差异表达基因(DEG)；对HCC组织中上调的DEG进行基因本体富集分析(GO)和京都基因与基因组百科全书富集分析(KEGG)后，阐明其参与的免疫信号通路，再用Cytoscape软件的cytoHubba功能、Degree方法筛选出10个关键基因；综合差异表达分析与生存分析结果，筛选出影响HCC组织中T_RM细胞的关键基因。结果 通过分析HCC的TCGA数据库，发现HCC组织中T_RM评分与HCC的临床和免疫特征有关，且T_R...