结核分枝杆菌Rv0824c基因编码蛋白的生物信息学分析

目的 采用生物信息学方法分析结核分枝杆菌的Rv0824c基因及其编码的DesA1蛋白结构和功能。方法 自NCBI网站获取Rv0824c基因及DesA1蛋白的基本信息；使用Protparam、ProtScale和ProtCompB预测DesA1蛋白的理化性质、亲疏水性和亚细胞定位；使用SignalP Server v.4.0、TMHMM Server v.2.0、NetNGlyc 1.0 server和NetPhos Server v.3.1预测DesA1蛋白的信号肽、跨膜结构、糖基化及磷酸化位点；使用SOPMA和SWISS MODEL预测DesA1蛋白的二级结构并构建该蛋白的三级结构模型；使用ABCpred和SYFPEITHI预测DesA1蛋白的抗原表位；使用MEGA软件构建系统发育树；使用STRING数据库预测DesA1的相互作用蛋白及相关功能。结果 Rv0824c基因全长1 017 bp,编码的DesA1蛋白氨基酸数为338,分子式为C₁₇₂₃H₂₆₉₄N₄₉₀O₅₀₃S₁₄