肺炎链球菌StkP蛋白B细胞及T细胞抗原表位的生物信息学分析

目的 运用生物信息学方法对肺炎链球菌StkP基因编码蛋白的理化性质、结构等进行分析，并预测其潜在的B细胞以及T细胞抗原表位。方法 通过NCBI数据库获取StkP蛋白氨基酸序列的相关信息；运用ProtParam软件分析StkP蛋白的理化性质；采用ProScale软件预测StkP蛋白的亲水性、柔韧性、表面可及性、β-转角；使用SOMPA和SWISS-MODEL在线服务器分析StkP蛋白的二级结构并构建其三级结构；分别采用ABCpred及IEDB软件综合预测其B细胞表位，采用SYFPEITHI软件分析确定其T细胞表位。结果 StkP蛋白由659个氨基酸组成，理论pI值8.61,原子组成为C₃₁₉₇H₅₂₃₄N₈₇₂O₉₉₇S₁₄,不稳定指数为40.13,归类为不稳定蛋白，平均亲水系数(GRAVY):-0.294,属于亲水性蛋白；StkP蛋白的二级结构中α螺旋占33.08%,延伸链占19.58%,β-转角占7.74%,无规卷曲占39.61%。ABCpred及IEDB软件预测StkP蛋白...