内蒙古长爪沙鼠鼠疫疫源地鼠疫菌耐药相关基因检测及生物信息学分析

目的 了解内蒙古长爪沙鼠鼠疫疫源地分离的鼠疫菌携带耐药及耐消毒剂基因情况，同时分析其结构功能和抗原表位，为鼠疫的治疗提供科学依据。方法 对75株分离自内蒙古长爪沙鼠鼠疫自然疫源地的鼠疫菌DNA进行PCR扩增，检测耐磺胺类药物基因(Sull、Sul2),耐链霉素基因(StrA、StrB),耐β-内酰胺类抗菌药物基因(Tem、CTX-m)和耐季铵盐类消毒剂基因(QacEdelta1)携带情况。同时分析Sul2基因的结构、功能及作为优势抗原的可能性。结果 PCR扩增显示，75株鼠疫菌均未检出上述耐药基因和耐消毒剂基因。生物信息学分析Sul2蛋白为不含有跨膜区的疏水性分泌蛋白，且属于外膜蛋白。其二级结构均以α螺旋和无规则卷曲为主，分别45.39%和33.21%。该蛋白含有6个B细胞表位和16个T细胞抗原表位。结论 内蒙古长爪沙鼠鼠疫疫源地分离的75株鼠疫菌不具有耐药及耐消毒剂的特征。鼠疫菌的Sul2蛋白含有丰富的B、T细胞抗原表位，具有良好的抗原性，可为该疫源地鼠疫诊断和治疗提供参考。