| 应用基因表达谱芯片技术筛选HCV p7蛋白反式调节基因 |
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| 引用本文： | 郭江,成军,洪源,王琦,邢卉春,毛羽. 应用基因表达谱芯片技术筛选HCV p7蛋白反式调节基因[J]. 中国肝脏病杂志(电子版), 2010, 2(1): 5-9 |
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| 作者姓名： | 郭江 成军 洪源 王琦 邢卉春 毛羽 |
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| 作者单位： | 1. 首都医科大学北京地坛医院,内五科,北京,100015
2. 首都医科大学北京地坛医院,传染病研究所,北京,100015 |
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| 摘 要： | 目的应用基因芯片技术对pcDNA3.1(-)和pcDNA3.1(-)-p7分别转染的HepG2细胞的基因表达谱进行分析,筛选能被HCV p7蛋白反式调节的靶基因,研究p7蛋白的生物学功能。方法以含有HCV全基因组的pBRTM质粒作为模板,应用聚合酶链反应(PCR)扩增p7蛋白编码基因片段,以常规的分子生物学技术构建表达载体pcDNA3.1(-)-p7。以脂质体技术转染肝母细胞瘤细胞系HepG2,提取总mRNA,逆转录为cDNA,与转染空白表达载体pcDNA3.1(-)的HepG2细胞进行DNA芯片分析并比较。结果构建的表达载体经过限制性内切酶分析和DNA序列测定,证实准确无误,提取高质量的总mRNA并逆转录成cDNA,进行DNA芯片技术分析。在1152个基因表达谱的筛选中,有1个基因表达水平显著上调,22个基因表达水平显著下调。结论 HCV p7蛋白是一种反式调节因子,p7基因的表达对于肝细胞基因表达谱有显著影响。
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| 关 键 词： | 丙型肝炎病毒 p7蛋白 反式调节 |
Screening and identification of genes trans-regulated by HCV p7 protein with microarray assay |
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| GUO Jiang,CHENG Jun,HONG Yuan,WANG Qi,XING Hui-chun,MAO Yu. Screening and identification of genes trans-regulated by HCV p7 protein with microarray assay[J]. Chinese Journal of Liver Diseases(Electronic Version), 2010, 2(1): 5-9 |
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| Authors: | GUO Jiang CHENG Jun HONG Yuan WANG Qi XING Hui-chun MAO Yu |
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| Affiliation: | 1.The Fifth Department of Internal Medicine,Beijing Ditan Hospital,Capital Medical University,Beijing 100015,China;2.Institute of Infectious Diseases,Beijing Ditan Hospital,Capital Medical University,Beijing 100015,China) |
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| Abstract: | 目的应用基因芯片技术对pcDNA3.1(-)和pcDNA3.1(-)-p7分别转染的HepG2细胞的基因表达谱进行分析,筛选能被HCV p7蛋白反式调节的靶基因,研究p7蛋白的生物学功能。方法以含有HCV全基因组的pBRTM质粒作为模板,应用聚合酶链反应(PCR)扩增p7蛋白编码基因片段,以常规的分子生物学技术构建表达载体pcDNA3.1(-)-p7。以脂质体技术转染肝母细胞瘤细胞系HepG2,提取总mRNA,逆转录为cDNA,与转染空白表达载体pcDNA3.1(-)的HepG2细胞进行DNA芯片分析并比较。结果构建的表达载体经过限制性内切酶分析和DNA序列测定,证实准确无误,提取高质量的总mRNA并逆转录成cDNA,进行DNA芯片技术分析。在1152个基因表达谱的筛选中,有1个基因表达水平显著上调,22个基因表达水平显著下调。结论 HCV p7蛋白是一种反式调节因子,p7基因的表达对于肝细胞基因表达谱有显著影响。 |
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| Keywords: | Hepatitis C virus p7 protein Trans-regulation |
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