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基于统计组合与CpG含量分类的基因预测算法
引用本文:童庆,郑浩然,宁岩,王煦法.基于统计组合与CpG含量分类的基因预测算法[J].北京生物医学工程,2007,26(2):178-181,190.
作者姓名:童庆  郑浩然  宁岩  王煦法
作者单位:中国科学技术大学计算机科学与技术系,合肥,230027;中国科学技术大学计算机科学与技术系,合肥,230027;中国科学技术大学计算机科学与技术系,合肥,230027;中国科学技术大学计算机科学与技术系,合肥,230027
基金项目:中国科技大学校科研和教改项目
摘    要:基因预测是研究基因功能、基因表达、基因之间的关联关系以及如何控制基因转录等工作的基础.现有的基因预测方法在预测内部编码外显子方面能达到较高的精度,但在预测5'端外显子方面却存在着不足.本文针对5'端外显子,构建了一种基于统计组合与CpG含量分类的基因预测算法:将基因区域数据根据CpG含量分成2个相对独立的集合,采用统计组合的方法将多种基因预测方法综合在一起进行基因预测研究.实验结果表明该算法提高了基因预测的精度,为进一步研究基因预测提供了一种可能的方案.

关 键 词:基因预测  CpG含量  线性组合  统计组合
文章编号:1002-3208(2007)02-0178-04
收稿时间:2006-03-29
修稿时间:2006-03-292006-05-11

A gene-prediction algorithm based on the statistical combination and the classification in terms of CpG content
TONG Qing,ZHENG Haoran,NING Yan,WANG Xufa.A gene-prediction algorithm based on the statistical combination and the classification in terms of CpG content[J].Beijing Biomedical Engineering,2007,26(2):178-181,190.
Authors:TONG Qing  ZHENG Haoran  NING Yan  WANG Xufa
Institution:Department of Computer Science and Technology, University of Science and Technology of China, Hefei 230027
Abstract:
Keywords:gene-prediction  CpG content  linear combination  statistical combination
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