新疆哈萨克族食管鳞癌差异表达mRNA的筛选 |
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引用本文: | 林怡秀,向辉,李阳,邵生辉,张健,郑勇,陈卫刚.新疆哈萨克族食管鳞癌差异表达mRNA的筛选[J].安徽医科大学学报,2022(3):482-487. |
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作者姓名: | 林怡秀 向辉 李阳 邵生辉 张健 郑勇 陈卫刚 |
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作者单位: | 石河子大学医学院第一附属医院消化内科 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(编号:81260362); |
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摘 要: | 目的 对新疆哈萨克族食管鳞癌(ESCC)组织与正常组织间差异表达的mRNA进行基因芯片筛选,进一步了解ESCC发生、发展机制。方法 利用基因芯片对5对新疆哈萨克族ESCC组织与癌旁正常组织(距癌组织>5 cm)中mRNA进行筛选;利用R软件及R软件包进行生物信息学分析;结合生物信息学工具metascape对差异基因行GO功能注释和KEGG通路富集分析;利用生物信息学网站STRING及Cytoscape软件寻找核心基因;搜集23例新疆哈萨克族ESCC组织和20例癌旁正常组织,对核心基因PLAUR进行免疫组化验证。结果 最终筛选出哈萨克族ESCC差异表达的mRNA 1 764个(差异倍数≥2且P<0.01);差异表达的mRNA中上调的基因378个,下调的基因1 368个,这些差异表达的mRNA涉及了一系列生物学功能及通路;免疫组化结果显示核心基因PLAUR在哈萨克族ESCC中表达高于癌旁正常组织。结论 该研究通过基因芯片筛选出新疆哈萨克族ESCC组织与癌旁正常组织中差异表达的mRNA,找出了其中的核心基因,完善了新疆哈萨克族ESCC基因谱,为ESCC诊断、预后的进一步研究打下基...
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关 键 词: | 基因芯片 食管癌 信使RNA |
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