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霍乱弧菌JS9803株CTXEI Torφ和nct-CTXnewO139φ基因组克隆、测序及序列分析
引用本文:芮勇宇,阚飙,高守一,刘延清,祁国明. 霍乱弧菌JS9803株CTXEI Torφ和nct-CTXnewO139φ基因组克隆、测序及序列分析[J]. 热带医学杂志, 2006, 6(8)
作者姓名:芮勇宇  阚飙  高守一  刘延清  祁国明
作者单位:1. 南方医科大学南方医院检验科,广州,510515
2. 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所,北京,102206
基金项目:国家自然科学基金(No.30470099和No.30170821)。
摘    要:目的霍乱弧菌JS9803株CTXEITorφ和nct-CTXnewO139φ基因组克隆、测序及序列分析。方法基因亚克隆、测序及序列生物信息学分析。结果霍乱弧菌9803株CTXEITorφ基因组与EITor类型的高度同源,RS区为双拷贝,核心区为单拷贝,RS侧和核心区侧染色体部分序列分别为TLC和RTX基因簇。nct-CTXnewO139φ基因组与已报道的其它类型比较,rstR基因及推测的氨基酸序列同源性分别为27.6%~50.5%和14.1%~48.4%,间隔区ig-2基因同源性25.2%~29.6%,表明rstR-ig2为新类型,该基因组附近染色体部分序列也为新发现的基因。结论在霍乱弧菌中发现新类型rstR-ig2的nct-CTXnewO139φ基因组,并和CTXEITorφ基因组共存。

关 键 词:霍乱弧菌  噬菌体  序列分析

Cloning, Sequencing and Analysis of CTXEI Torφ and nct-CTXnewO139φ Genomes of Vibrio cholerae JS9803
RUI Yong-yu,KAN Biao,GAO Shou-yi,LIU Yan-qing,QI Guo-ming. Cloning, Sequencing and Analysis of CTXEI Torφ and nct-CTXnewO139φ Genomes of Vibrio cholerae JS9803[J]. Journal Of Tropical Medicine, 2006, 6(8)
Authors:RUI Yong-yu  KAN Biao  GAO Shou-yi  LIU Yan-qing  QI Guo-ming
Abstract:
Keywords:Vibrio cholerae  phage  sequence analysis
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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