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基于生物信息学分析花生四烯酸代谢在缺血性心脏病中的作用
作者姓名:杨雪剑  陈虹  王淼
作者单位:中国医学科学院北京协和医学院阜外医院国家心血管病中心心血管疾病国家重点实验室
基金项目:国家重点研发计划主动健康和老龄化科技应对重点专项基金(2020YFC2008000);;国家自然科学基金重点国际合作基金(82320108002,92149305);
摘    要:目的 基于生物信息学分析缺血性心脏病(IHD)患者花生四烯酸代谢通路(AMP)基因差异表达情况,并探讨AMP基因在IHD发生与发展中的作用。方法 对IHD患者和健康对照者心脏组织转录组数据进行分析以鉴定差异表达基因,并运用机器学习算法筛选与IHD相关的AMP关键基因。这些核心基因被用于IHD诊断模型的开发和验证,并结合单细胞转录组数据进一步研究这些基因在IHD中的功能。结果 转录组数据分析显示,AMP基因在IHD中表达失调,并且鉴定出5个核心基因:PLA2G2A、CYP2J2、ACE、GPX3和EPHX2。基于这5个核心基因构建的模型在训练集和验证集中均表现出良好的诊断性能。这些核心基因主要在成纤维细胞和心肌细胞中表达,并与多种炎症因子及M2型巨噬细胞浸润高度相关。结论 PLA2G2A、CYP2J2、ACE、GPX3和EPHX2可作为IHD的诊断标志物,并与IHD中免疫细胞浸润密切相关。这些发现将为深入研究IHD疾病机制及开发靶向药物提供参考。

关 键 词:缺血性心脏病  花生四烯酸  生物信息学
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