| 一种基于单核苷酸多态性位点的定量检测异基因造血干细胞移植后嵌合率的新方法 |
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| 引用本文： | 邵宇,王健民,龚胜兰,蔡在龙,章卫平,宋献民,王利平.一种基于单核苷酸多态性位点的定量检测异基因造血干细胞移植后嵌合率的新方法[J].中华血液学杂志,2010,31(2). |
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| 作者姓名： | 邵宇 王健民 龚胜兰 蔡在龙 章卫平 宋献民 王利平 |
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| 作者单位： | 第二军医大学附属长海医院血液科,上海,200433 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金，上海市卫生系统基金，第二军医大学博士创新基金，上海市生物医学重大科技攻关项目 |
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| 摘 要： | 目的 建立一种单核苷酸多态性-聚合酶链反应(SNP-PCR)定量检测异基因造血干细胞移植后供受嵌合率的新方法 ,探讨其可行性、准确性及优越性.方法 利用18个SNP位点筛选移植前每一对供、受者,采用实时定量PCR(RQ-PCR)对筛选出的差异位点行嵌合率定量分析,通过倍比稀释、模拟嵌合与微卫星重复序列-PCR(STR-PCR)、性染色体双色荧光原位杂交(XY-FISH)和融合基因的定量检测,比较、验证方法 的准确性及敏感度.结果①利用内参质粒标准品扩增的17次标准曲线,平均斜率为-3.39,平均截距为39.97,相关系数均＞0.995,扩增效率接近理想水平;批内差及批间差分别为0.50%和1.10%,在可控范围;与模拟混合嵌合相关系数在0.99以上;可重复敏感度达0.01%.②40例移植患者中,95%以上可以筛选出供、受者差异SNP位点;SNP-PCR与STR-PCR结果吻合率达96.7%,与XY-FISH结果比较差异无统计学意义(P＞0.05);SNP-PCR与特定白血病融合基因检测结果比较,完全嵌合(CC)标本均未检出肿瘤相关的融合基因,部分嵌合(MC)标本融合基因均为阳性.结论 SNP-PCR检测嵌合率准确、敏感、易行,具有极高的临床应用前景,克服了STR-PCR竞争抑制及扩增平台期偏倚的缺点,可以替代其进行临床常规检测.
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| 关 键 词： | 造血干细胞移植 嵌合体 多态性 单核苷酸 聚合酶链反应 |
A novel single nucleotide polymorphism-based method for quantitative assessment of chimerism after allogeneic stem cell transplantation |
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| SHAO Yu,WANG Jian-min,GONG Sheng-lan,CAI Zai-long,ZHANG Wei-ping,SONG Xian-min,WANG Li-ping.A novel single nucleotide polymorphism-based method for quantitative assessment of chimerism after allogeneic stem cell transplantation[J].Chinese Journal of Hematology,2010,31(2). |
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| Authors: | SHAO Yu WANG Jian-min GONG Sheng-lan CAI Zai-long ZHANG Wei-ping SONG Xian-min WANG Li-ping |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Hematopoietic stem cell transplantation Chimerism Polymorphism single nucleotide Polymerase chain reaction |
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