| 铁皮石斛丙酮酸激酶基因的克隆与表达分析 |
| |
| 引用本文： | 张 琳,蔡 茜,张大为,张 岗,郭顺星. 铁皮石斛丙酮酸激酶基因的克隆与表达分析[J]. 中草药, 2014, 45(7): 990-995 |
| |
| 作者姓名： | 张 琳 蔡 茜 张大为 张 岗 郭顺星 |
| |
| 作者单位： | 1. 陕西中医学院药学院 陕西省中药基础与新药研究重点实验室，陕西 西安 712046 2. 中国医学科学院 北京协和医学院药用植物研究所，北京 100193 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目（31070300，31101608）；陕西省科技计划青年科技新星项目（2012KJXX-44） |
| |
| 摘 要： | 目的 克隆珍稀濒危药用植物铁皮石斛丙酮酸激酶（pyruvate kinase，PK）基因（DoPK），并进行生物信息学分析以及检测基因在不同器官中的表达情况。方法 采用RACE技术获得基因的全长cDNA；利用生物信息学软件预测蛋白的理化性质、结构域及亚细胞定位等分子特性；用DNASTAR 6.0和MEGA 4.0分别进行氨基酸多序列比对和进化关系分析；借助r实时荧光 (real-time quantitative) PCR (RT-qPCR)分析基因在不同器官中的表达情况。结果 克隆获得DoPK（GenBank注册号KC178572）的cDNA全长1 895 bp，编码一条由511个氨基酸组成的多肽，相对分子质量为55 040，等电点7.00；DoPK基因与江南卷柏、拟南芥、马铃薯和葡萄等植物的PK基因有71%、86%、89%和91%的相似性；DoPK蛋白包含保守的丙酮酸激酶结构域（21～497）和活性位点（235～247）；DoPK属于胞质型的CYTOSOLIC-1亚类，与单子叶植物亲缘关系较近；DoPK基因为组成型表达，其转录本在石斛茎中的相对表达量较高，为叶中的2.29倍，根中次之,为叶中的1.28倍。结论 克隆了胞质型的铁皮石斛DoPK基因的全长cDNA序列，为进一步研究其在铁皮石斛生长发育中的作用奠定基础。
|
| 关 键 词： | 铁皮石斛；丙酮酸激酶；基因克隆；表达分析；生物信息学 |
Cloning and expression analysis of pyruvate kinase gene in Dendrobium officinale |
| |
| ZHANG Lin,CAI Xi,ZHANG Da-wei,ZHANG Gang,GUO Shun-xing. Cloning and expression analysis of pyruvate kinase gene in Dendrobium officinale[J]. Chinese Traditional and Herbal Drugs, 2014, 45(7): 990-995 |
| |
| Authors: | ZHANG Lin CAI Xi ZHANG Da-wei ZHANG Gang GUO Shun-xing |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Dendrobium officinale Kimura et Migo pyruvate kinase gene cloning expression analysis bioinformatics |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
| 点击此处可从《中草药》浏览原始摘要信息 |
|
点击此处可从《中草药》下载全文 |
