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幽门螺杆菌Cag-PAI hp0523基因的克隆及功能预测
引用本文:邵世和,钟桥,黄世腾,韩军,黄河,田树伟.幽门螺杆菌Cag-PAI hp0523基因的克隆及功能预测[J].江苏大学学报(医学版),2009,19(2).
作者姓名:邵世和  钟桥  黄世腾  韩军  黄河  田树伟
作者单位:1. 江苏大学基础医学与医学技术学院病原生物学研究室
2. 江苏大学生命科学研究院,江苏,镇江,212013
基金项目:国家自然科学基金,江苏省高校自然科学基金 
摘    要:目的:明确幽门螺杆菌Cag-PAI hp0523基因的功能,探讨其在幽门螺杆菌致病中的作用.方法:设计引物,以幽门螺杆菌NCTC11637为模板,采用聚合酶链反应(PCR)扩增获得目的片段;将其进行T-A克隆后,进行测序.将该基因序列与其他菌株做BLAST比对分析,并结合生物信息学数据库和软件,分析其序列特征和理化特性.结果:经酶切,测序分析表明,插入的基因片断为510 bp,与基因库公布的幽门螺杆菌 26695及J99序列相比较,同源性高达 94%;软件预测其编码的蛋白为169个氨基酸,其相对分子质量约为19.7 kDa,等电点约为9.53;基序分析表明,在33~165位氨基酸之间存在一个保守的SLT催化基序,可能是溶菌糖基转移酶;对其催化能力进行预测,结果表明,HP0523(33.7%)催化能力可能较T4溶菌酶(32.3%)和溶菌酶SLT70(28.6%)的活性高.结论:成功克隆了幽门螺杆菌Cag-PAI的hp0523基因,对其序列进行了深入分析,为进一步研究其功能,阐明幽门螺杆菌Cag-PAI的致病机制奠定了基础.

关 键 词:幽门螺杆菌  Cag致病岛  功能预测  溶菌糖基转移酶

Cloning and functional prediction of hp0523 gene from Cag-PAI in Helicobacter pylori
SHAO Shi-he,ZHONG Qiao,HUANG Shi-teng,HAN Jun,HUANG He,TIAN Shu-wei.Cloning and functional prediction of hp0523 gene from Cag-PAI in Helicobacter pylori[J].Journal of Jiangsu University Medicine Edition,2009,19(2).
Authors:SHAO Shi-he  ZHONG Qiao  HUANG Shi-teng  HAN Jun  HUANG He  TIAN Shu-wei
Abstract:
Keywords:
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