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| 基于创新的四维密码方法分析共调控与蛋白互作关系 | |
| 引用本文： | 宿菲,张帆,吴超,肖雪,宿晟阳,李霞. 基于创新的四维密码方法分析共调控与蛋白互作关系[J]. 国际遗传学杂志, 2008, 31(3). DOI: 10.3760/cma.j.issn.1673-4386.2008.06.002 |
| 作者姓名： | 宿菲 张帆 吴超 肖雪 宿晟阳 李霞 |
| 作者单位： | 1. 哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院,150081 2. 首都医科大学生物医学工程学院,北京,100069 3. 哈尔滨理工大学计算机科学与技术学院,150080 4. 150081,哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院100069;北京,首都医科大学生物医学工程学院;200092,上海,同济大学生命科学与技术学院 |
| 基金项目： | 国家自然科学基金，国家高技术研究发展计划(863计划)，黑龙江省科技攻关计划，黑龙江省卫生厅普通资助项目，黑龙江省教育厅研究项目 |
| 摘 要： | 【摘要】目的 基于创新的四维密码子的方法挖掘共调控且互作的基因对，研究共调控与蛋白互作之间的关联趋势。方法 我们提出了创新的基于四维密码子的关联分析方法，并把此方法应用于与结肠癌相关的2000个疾病基因。结果 发现共调控的互作蛋白对比随机情况下显著；随着共调控强度的增强，蛋白间互作趋势越来越明显。结论 基于创新的四维密码子的关联分析方法，能够研究共调控与蛋白互作的关联趋势。 |
| 关 键 词： | 共调控 互作蛋白 四联密码子 关联趋势 |
| 收稿时间： | 2008-04-07 |
An Analysis of the Relationship Between Co-regulation and Interaction Proteins based on Novel 4-Dim Codons Method |
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| SU Fei,ZHANG Fan,WU Chao,XIAO Xue,SU Sheng-yang,LI Xia. An Analysis of the Relationship Between Co-regulation and Interaction Proteins based on Novel 4-Dim Codons Method[J]. International JOurnal of Genetics, 2008, 31(3). DOI: 10.3760/cma.j.issn.1673-4386.2008.06.002 | |
| Authors: | SU Fei ZHANG Fan WU Chao XIAO Xue SU Sheng-yang LI Xia |
| Abstract: | Objective To dig co-regulation and interaction proteins pairs,and to investigate the association tendency of co-regulation and proteins interaction based on novel 4-D codons method.Methods A novel association method based on 4-D codons is proposed,and is used to 2000 correlative colon carcinoma genes.Results Interacting-protein pairs,in which the proteins are co-regulated,tend to be more significant than at random,The more intense,the co-regulated is getting,the more distinct the interacting proteins tending to be co-regulated is.Conclusion According to the association analysis method based on 4-D codons,the article analyzes the association tendency between co-regulation and protein interacting. |
| Keywords: | Co-regulation Interaction protein 4-D codons Association tendency |
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