| 滇龙胆居群遗传多样性和遗传结构分析 |
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| 引用本文： | 沈涛,虞泓,王元忠.滇龙胆居群遗传多样性和遗传结构分析[J].中草药,2023,54(3):926-938. |
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| 作者姓名： | 沈涛 虞泓 王元忠 |
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| 作者单位： | 玉溪师范学院化学生物与环境学院, 云南 玉溪 653100;云南大学生态学与环境学院云百草实验室, 云南 昆明 650091;云南省农业科学院药用植物研究所, 云南 昆明 650200 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（32060086）；云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目（202205AC160088） |
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| 摘 要： | 目的 揭示不同分布区滇龙胆Gentiana rigescens的遗传多样性与遗传结构。方法 基于GBS(genotyping-by-sequencing)简化基因组(reduced-representation genome sequencing,RRGS)技术对采自云南、四川和贵州的19个居群147株滇龙胆进行测序；利用样本SNPs数据集结合聚类树分析、主成分分析、遗传结构分析、Mantel检验等方法，从基因组水平研究滇龙胆居群的遗传多样性与遗传结构；结果 聚类树分析、主成分分析及遗传结构分析显示，不同分布区采集的样品有明显的基因型差异；依据样品地理来源，19个居群大致可分为横断山区(分布于滇西北和川西南的居群)及云贵高原(分布于滇西、滇中、滇东南及贵州的居群)2个亚群。通过观测观测杂合度(observed heterozygosity,Ho)、期望杂合度(expected heterozygosity,He)、多态信息含量(polymorphic information,PIC)、Shannon多样性指数(shannon’s diversity index,I)、Nei’s多样性指...
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| 关 键 词： | 滇龙胆 遗传多样性 遗传结构 简化基因组测序 资源评价 |
| 收稿时间： | 2022/11/6 0:00:00 |
Population genetic diversity and genetic structure of Gentiana rigescens |
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| SHEN Tao,YU Hong,WANG Yuan-zhong.Population genetic diversity and genetic structure of Gentiana rigescens[J].Chinese Traditional and Herbal Drugs,2023,54(3):926-938. |
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| Authors: | SHEN Tao YU Hong WANG Yuan-zhong |
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| Institution: | College of Chemistry, Biology and Environment, Yuxi Normal University, Yuxi 653100, China;Yunnan Herbal Laboratory, School of Ecology and Environmental Science, Yunnan University, Kunming 650091, China; Institute of Medicinal Plants, Yunnan Academy of Agricultural Sciences, Kunming 650200, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Gentiana rigescens genetic diversity genetic structure simplified genome sequencing technology resource evaluation |
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