| 糖尿病肾脏病竞争性内源RNA网络构建及潜在中药预测研究 |
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| 引用本文： | 安琪,杨宇峰,石岩. 糖尿病肾脏病竞争性内源RNA网络构建及潜在中药预测研究[J]. 中草药, 2023, 54(2): 620-630 |
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| 作者姓名： | 安琪 杨宇峰 石岩 |
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| 作者单位： | 辽宁中医药大学, 辽宁 沈阳 110847 |
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| 基金项目： | 辽宁省“兴辽英才计划”青年拔尖人才项目(XLYC1807145);辽宁省人社厅百千万人才资助项目(20200512) |
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| 摘 要： | 目的 基于生物信息学构建糖尿病肾病（diabetic nephropathy,DN）竞争性内源RNA(competing endogenous RNA,ce RNA)网络,预测治疗DN潜在有效中药。方法 利用GEO数据库与R语言获取DN差异表达长链非编码RNA(differentially expressed lncRNA,DElncRNA)及差异表达信使RNA(differentially expressed mRNA,DEmRNA),借助miRcode、Target Scan、miRTarBase、mi RDB数据库整合“DElncRNA-微小RNA(microRNA,miRNA)”与“miRNA-DEmRNA”调控关系,通过Cytoscape 3.7.2软件构建ce RNA调控网络,采用Metascape平台分析ce RNA调控网络主要涉及生物过程及信号通路,借助String数据库与Cytoscape 3.7.2软件获取关键基因,并将其映射到Coremine Medical数据库中,预测治疗DN潜在中药,通过TCMSP、PubChem、UniProt、SwissTargetPre...
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| 关 键 词： | 糖尿病肾脏病 竞争性内源RNA网络 中药预测 长链非编码RNA 雷公藤 藤黄 黄芪 三七 槲皮素 藤黄酸 异藤黄酸 山柰酚 gambogellic acid |
| 收稿时间： | 2022-09-17 |
Construction of competitive endogenous RNA network in diabetic nephropathy and prediction of potential Chinese medicine |
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| AN Qi,YANG Yu-feng,SHI Yan. Construction of competitive endogenous RNA network in diabetic nephropathy and prediction of potential Chinese medicine[J]. Chinese Traditional and Herbal Drugs, 2023, 54(2): 620-630 |
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| Authors: | AN Qi YANG Yu-feng SHI Yan |
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| Affiliation: | Liaoning University of Traditional Chinese Medicine, Shenyang 110847, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | diabetic nephropathy competitive endogenous RNA network prediction of traditional Chinese medicine long chain non-coding RNA Tripterygium wilfordii Hook. f. Garcinia hanburyi Hook. f. Astragali Radix Notoginseng Radix et Rhizoma quercetin morellic acid isomorellic acid kaempferol gambogellic acid |
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