| 生物信息学分析亚洲牛带绦虫WD40基因及其蛋白质的结构与功能 |
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| 引用本文： | 郎书源,杜武英,黄江,胡旭初,徐劲,余新炳,包怀恩,廖兴江. 生物信息学分析亚洲牛带绦虫WD40基因及其蛋白质的结构与功能[J]. 热带医学杂志, 2008, 8(7) |
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| 作者姓名： | 郎书源 杜武英 黄江 胡旭初 徐劲 余新炳 包怀恩 廖兴江 |
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| 作者单位： | 1. 贵阳医学院寄生虫学教研室,贵阳,550004
2. 中山大学中山医学院寄生虫学教研室,广州,510080 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金 , 贵州省科技攻关项目 , 贵阳医学院青年基金 |
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| 摘 要： | 目的 分析和预测亚洲牛带绦虫WD40基因及其编码蛋白的结构和特性,用于指导其生物学功能的实验研究.方法 利用美国国家生物技术信息中心(NCBI,http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)、瑞士生物信息学研究所的蛋白分析专家系统(ExPASY,http://ca.expasy.org/)和IEDB Analysis Recource提供的各种生物信息学在线分析程序.结合其它生物信息学分析软件包如Pcgene和Vector NTI suite,从亚洲牛带绦虫全长cDNA质粒文库中识别WD40基因及其编码区,分析、预测该基因编码的蛋白质的理化特性、翻译后的修饰位点、功能域、亚细胞定位、拓扑结构、二级结构、三维空间构象等.结果 该基因全长1 208 bp,编码区为81～1 056 bp,编码402个氨基酸,为全长基因;无跨膜区,具有多个磷酸化位点,蛋白的理化性质稳定,理论分子量为35 942.4;没有质体、线粒体定位序列;预测该蛋白表面有三个亲水性强的线性表位和三个B细胞抗原表位.结论 应用生物信息方法从亚洲牛带绦虫成虫cDNA文库中识别出了亚洲牛带绦虫WD40基因,并对其所编码的蛋白质的结构与功能进行了预测.
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| 关 键 词： | 亚洲牛带绦虫 WD40 结构与功能 生物信息学 |
Bioinformatics Analysis of the Structure and Function of the Gene Encoding WD40 Protein from Taenia saginata asiatica |
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| LANG Shu-yuan,DU Wu-ying,HUANG Jiang,HU Xu-chu,XU Jin,YU Xin-bing,BA Huai-en,LIAO Xing-jiang. Bioinformatics Analysis of the Structure and Function of the Gene Encoding WD40 Protein from Taenia saginata asiatica[J]. Journal Of Tropical Medicine, 2008, 8(7) |
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| Authors: | LANG Shu-yuan DU Wu-ying HUANG Jiang HU Xu-chu XU Jin YU Xin-bing BA Huai-en LIAO Xing-jiang |
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