基于数据库挖掘分析FN1、COL4A1、COL4A2基因在胃癌中的表达及意义 |
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引用本文: | 雷昕奕,宋丹军,戴丐国,张云利,杨立涛.基于数据库挖掘分析FN1、COL4A1、COL4A2基因在胃癌中的表达及意义[J].中华全科医学,2023(11):1967-1971. |
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作者姓名: | 雷昕奕 宋丹军 戴丐国 张云利 杨立涛 |
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作者单位: | 1. 浙江省肿瘤医院胃外科中国科学院基础医学与肿瘤研究所;2. 浙江省肿瘤医院介入治疗科中国科学院基础医学与肿瘤研究所 |
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摘 要: | 目的 基于数据库挖掘分析胃癌预后预测和胃癌靶向治疗的潜在关键基因(Hub基因)。方法 本研究选取基因表达综合数据库(GEO)的GSE33651和GSE118916数据集(研究时间为2011年11月—2019年8月)。GEO2R进行胃癌差异表达基因(DEGs)分析。DAVID数据库对DEGs进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。采用STRING数据库和Cytoscape软件构建DEGs的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,其中Degree>10的DEGs被认为是Hub基因。基于癌症基因组图谱(TCGA)的胃腺癌数据,使用OncoLnc和UALCAN数据库对Hub基因进行生存分析和表达分析。TIMER数据库对Hub基因进行免疫浸润分析。结果 GSE33651和GSE118916中鉴定出80个共有上调和34个共有下调DEGs。DEGs富集在69个GO条目和7个KEGG信号通路。从PPI网络中筛选出14个Hub基因。FN1、COL4A2和COL4A1基因在胃癌组织的表达水平均显著高于胃正常组织,且在胃癌中具有良好的预后预测价值。FN1、COL4A2和COL...
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关 键 词: | 胃癌 差异表达基因 关键基因 预后 免疫浸润 |
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