| 我国HIV-1 CRF07_BC流行重组毒株Tat蛋白第一外显子CTL表位预测 |
| |
| 引用本文： | 方志明,邢辉,孟哲峰,洪坤学,廖玲洁,何翔,吕建新,邵一鸣.我国HIV-1 CRF07_BC流行重组毒株Tat蛋白第一外显子CTL表位预测[J].中华微生物学和免疫学杂志,2010,30(2). |
| |
| 作者姓名： | 方志明 邢辉 孟哲峰 洪坤学 廖玲洁 何翔 吕建新 邵一鸣 |
| |
| 作者单位： | 1. 温州医学院生命科学学院,325035
2. 中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防控制中心,传染病国家重点实验室,北京,100050 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金，科技部科研项目，重大传染病专项项目 |
| |
| 摘 要： | 目的 通过测定和分析我国HIV-1 CRF07_BC毒株Tat蛋白第一外显子的基因序列预测其CTL表位的分布情况.方法 236份来自第3次全国HIV分子流行病学调查中感染CRF07_BC毒株的患者的血浆样本,应用巢式聚合酶链反应(nested-PeR)扩增tat基因第一外显子基因区并测序,使用BIMAS HLA Peptide Binding Predictions在线软件和统计学软件对CTL表位进行预测分析.结果 236份CRF07_BC毒株来自16个省份,主要为静脉吸毒传播(58.9%),其次为性传播(25.0%).236条CRF07_BC Tat蛋白第一外显子区共分布有12种CTL表位,主要分布于脯氨酸富集区、半胱氨酸富集区和疏水核心区,碱性区和谷氨酰胺富集区没有发现已知的CTL表位分布,这些表位主要受5种HLA基因型(A * 2501、A * 2902、B * 15、B * 5301和Cw * 1203)以及6种HLA血清型(B53、B58、B57、A3、A68和Cw12)限制,其中5种表位的单氨基酸变异频率大于50%.结论 我国HIV-1 CRF07_BC毒株Tat蛋白第一外显子CTL表位分布于不同功能区,并且存在氨基酸变异.
|
| 关 键 词： | 人免疫缺陷病毒 Tat蛋白 变异 表位 |
Prediction of CTL epitopes of Tat exon 1 region in HIV-1 CRF07_BC strains in China |
| |
| FANG Zhi-ming,XING Hui,MENG Zhe-feng,HONG Kun-xue,LIAO Ling-jie,HE Xiang,L Jian-xin,SHAO Yi-ming.Prediction of CTL epitopes of Tat exon 1 region in HIV-1 CRF07_BC strains in China[J].Chinese Journal of Microbiology and Immunology,2010,30(2). |
| |
| Authors: | FANG Zhi-ming XING Hui MENG Zhe-feng HONG Kun-xue LIAO Ling-jie HE Xiang L Jian-xin SHAO Yi-ming |
| |
| Institution: | FANG Zhi-ming,XING Hui,MENG Zhe-feng,HONG Kun-xue,LIAO Ling-jie,HE Xiang,L(U) Jian-xin,SHAO Yi-ming |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | Human immunodeficiency virus Tat protein Variation Epitope |
| 本文献已被 万方数据 等数据库收录！ |
|
