缺血性脑卒中m6A修饰与免疫微环境相关性分析 |
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引用本文: | 梁天,严雁,朱路路,黄小兰,赵直,钟清清,廖芳萍,温政,龙建雄,苏莉.缺血性脑卒中m6A修饰与免疫微环境相关性分析[J].内科,2023(1):1-7+26. |
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作者姓名: | 梁天 严雁 朱路路 黄小兰 赵直 钟清清 廖芳萍 温政 龙建雄 苏莉 |
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作者单位: | 1. 广西医科大学公共卫生学院;2. 广西中医药大学第一附属医院脑病科 |
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基金项目: | 广西自然科学基金项目(2018GXNSFDA050005);;国家自然科学基金项目(81874395); |
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摘 要: | 目的 初步探究N6-甲基腺苷(m6A)调节因子在缺血性脑卒中(IS)免疫微环境中的潜在作用与机制。方法 基于基因表达综合数据库(GEO),应用单样本基因集富集分析(ssGSEA)、一致性聚类分析和基因集富集分析(GSEA)等生物信息学方法综合分析m6A调节因子与IS免疫微环境的相关性。结果 Spearman相关分析结果显示,IGF2BP2 mRNA的表达与CD56亮自然杀伤细胞富集分数的正相关关系最强(rs=0.66),IGF2BP2 mRNA的表达与2型T辅助细胞富集分数的负相关关系最强(rs=-0.64);ELF3 mRNA的表达与TGFb家族成员富集分数的正相关关系最强(rs=0.56),ELAVL1 mRNA的表达与趋化因子富集分数的负相关关系最强(rs=-0.66)(均P<0.05)。一致性聚类分析确定了两种具有不同m6A修饰模式的IS亚型,亚型1中活化B细胞、活化CD4 T细胞、活化CD8 T细...
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关 键 词: | 缺血性脑卒中 N6-甲基腺苷 免疫微环境 聚类分析 富集分析 生物信息学 |
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