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椎间盘退变相关细胞焦亡基因的生物信息分析与功能鉴定题录
作者姓名:陈坤浩  孙红  杨华  刘淼  庄勇  宁旭
作者单位:贵州医科大学附属医院骨科
摘    要:目的通过生物信息技术筛选与椎间盘退变相关的细胞焦亡基因, 确定其生物学功能和信号通路。方法首先, 从基因表达谱(GEO)数据库中下载GSE147383数据集, 将细胞焦亡基因与该数据集差异表达基因作交集分析, 筛选细胞焦亡差异表达基因。再者, 对获得的细胞焦亡差异表达基因进行基因本体论(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析。同时, 绘制蛋白质-蛋白质相互作用网络, 筛选获得椎间盘退变细胞焦亡关键基因。其次, 通过受试者工作特征(ROC)曲线来评估关键基因的诊断价值并绘制关键基因线性预测模型。最后, 采用实时荧光定量聚合酶联反应(qRT-PCR)检测椎间盘退变髓核组织中的细胞焦亡相关基因表达水平。组间比较采用t检验。结果本研究共筛选获得8个椎间盘退变相关细胞焦亡基因, 即SR相关和CTD相关因子11(SCAF11)、富含亮氨酸重复结构域蛋白6(NLRP6)、肿瘤蛋白p53(TP53)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶4(CASP4)、谷胱甘肽过氧化物酶4(GPX4)、中性粒细胞弹性蛋白酶(ELANE)、常染色体隐形遗传性耳聋59蛋白(DFNB59)和常染色体显性遗传耳聋5蛋白(DFNA...

关 键 词:椎间盘退变  细胞焦亡  生物信息分析
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