基于加权基因共表达网络分析并验证胰腺癌增殖相关关键基因题录

目的基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选与胰腺癌细胞增殖相关的关键基因并进行验证。方法利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库和基因型-组织表达(GTEx)数据库生成的胰腺癌以及正常组织数据集产生差异表达基因(DEGs)。采用R软件包的limma算法识别DEGs, 校正后P<0.01且表达变化大于2倍的基因被鉴定为DEGs。采用Metascape数据库对DEGs的功能进行富集分析。使用R软件包进行WGCNA分析。使用R软件包的Survival功能进行生存分析;取30例就诊于河北医科大学第四医院胰腺癌患者的新鲜胰腺癌临床样本及癌旁组织, 应用荧光实时定量反转录聚合酶链式反应(RT-qPCR)检测部分筛目标基因mRNA表达水平。数据分析使用R软件及SPSS 25.0统计分析软件进行处理。结果 DEGs分析结果显示, 在胰腺癌组织中有12 044个基因表达上调, 有694个基因表达下调(P<0.01)。生存分析结果显示, 其中855个与患者预后显著相关的基因(P<0.01)。对影响预后的DEGs进行富集分析, 发现与DNA损伤修复、细胞周期转化、蛋白激酶活性调控等多种功...