| 基于组学数据分析的非小细胞肺癌亚型特征识别 |
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| 引用本文： | 胡 曦1,慕玉东2,吴晓明1,王丽娜1,杜建强1,马天有3. 基于组学数据分析的非小细胞肺癌亚型特征识别[J]. 现代肿瘤医学, 2018, 0(3): 375-378. DOI: 10.3969/j.issn.1672-4992.2018.03.013 |
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| 作者姓名： | 胡 曦1 慕玉东2 吴晓明1 王丽娜1 杜建强1 马天有3 |
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| 作者单位： | 1.西安交通大学生物医学信息工程教育部重点实验室，陕西 西安 7100492.陕西省肿瘤医院检验科，陕西 西安 7100613.西安交通大学医学部环境与疾病教育部重点实验室，陕西 西安 710061 |
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| 基金项目： | 陕西省科技计划项目（编号:2011K12-02-04，2011K12-04-06，2016SF-229） |
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| 摘 要： | 目的:探索非小细胞肺癌4种亚型在基因组、转录组层次的特征，实现对肿瘤类型的精确分型，获取能够体现非小细胞肺癌亚型的基因组学特征。方法:利用NMF聚类和生存时间分析，对TCGA数据库中的504个非小细胞肺癌样本的拷贝数变异数据和基因表达数据进行分析，对不同疾病亚型的差异表达基因进行富集分析。结果:所有肺癌患者可根据基因变异信息分为4个类别，它们具有不同的基因组特征，其生存时间曲线具有显著差异，同时发现吸烟是肺癌亚型的一个决定因素。结论:通过检测遗传特征和基因表达特征，有助于对非小细胞肺癌患者进行疾病亚型精准判定。
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| 关 键 词： | 肺鳞癌 基因组 生物信息 亚型识别 |
Lung squamous cell carcinoma subtyping and feature identification based on-omics data analysis |
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| Hu Xi1,Mu Yudong2,Wu Xiaoming1,Wang Lina1,Du Jianqiang1,Ma Tianyou3. Lung squamous cell carcinoma subtyping and feature identification based on-omics data analysis[J]. Journal of Modern Oncology, 2018, 0(3): 375-378. DOI: 10.3969/j.issn.1672-4992.2018.03.013 |
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| Authors: | Hu Xi1 Mu Yudong2 Wu Xiaoming1 Wang Lina1 Du Jianqiang1 Ma Tianyou3 |
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| Affiliation: | 1.The Key Laboratory of Biomedical Information Engineering of Ministry of Education，School of Life Science and Technology，Xi'an Jiaotong University，Shaanxi Xi'an 710049，China；2.Clinical Laboratory，Shaanxi Provincial Cancer Hospital，Shaanxi Xi'an 710061，C |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | squamous cell carcinoma genomics bioinformatics subtype identification |
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