| HIV-1 CRF01_AE毒株gp41蛋白生物信息学预测 |
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| 引用本文： | 邵继平,谢学立,刘莹,郭燕子,符健.HIV-1 CRF01_AE毒株gp41蛋白生物信息学预测[J].重庆医科大学学报,2020,45(2):234. |
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| 作者姓名： | 邵继平 谢学立 刘莹 郭燕子 符健 |
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| 作者单位： | 海南医学院海南省药物临床前药理毒理学研究重点实验室，海口 571199 |
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| 摘 要： | 目的：对HIV-1 gp41蛋白的膜外区和跨膜区进行预测，并分析该蛋白的结构和功能。方法：从NCBI GenBank数据库获取gp41基因及其蛋白编码序列，利用ExPASy ProtParam tool、ProtScale、SignalP 4.0 Server、TMHMM Server v.2.0、SWISS-MODEL、PredictProtein等工具对gp41蛋白的生物学特性进行预测。结果：HIV-1 gp41基因ORF长度为666 bp，编码222个氨基酸，蛋白分子式为C1164H1815N317O325S6，等电点（isoelectric point，pI）＝8.60，属于稳定、疏水性蛋白。该蛋白具有跨膜区，信号肽切割位点位于第20和21位氨基酸处。其二级结构由无规则卷曲、β折叠和α螺旋组成，属于全螺旋型蛋白。而且该蛋白具有N-端信号肽，能引导蛋白分泌到胞外。此外gp41蛋白具有4个蛋白质-蛋白质和1个蛋白质-核酸结合位点，这些位点能调控gp41蛋白的多种生物学功能。结论：对gp41蛋白的结构和功能进行了预测，为深入研究其参与疾病发生发展的分子机制奠定了基础。
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| 关 键 词： | HIV-1 包膜糖蛋白gp41 CRF01_AE毒株 生物信息学预测 |
Bioinformatic prediction of gp41 protein in HIV-1 CRF01_AE strain |
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| Shao Jiping,Xie Xueli,Liu Ying,Guo Yanzi,Fu Jian.Bioinformatic prediction of gp41 protein in HIV-1 CRF01_AE strain[J].Journal of Chongqing Medical University,2020,45(2):234. |
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| Authors: | Shao Jiping Xie Xueli Liu Ying Guo Yanzi Fu Jian |
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