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宏基因组测序技术检测感染性葡萄膜炎病原体的初步研究题录
摘    要:目的探讨宏基因组测序(MGS)技术在感染性葡萄膜炎诊断中的作用。方法横断面研究。对2016年3月至2018年7月首都医科大学附属北京同仁医院临床疑诊为感染性葡萄膜炎的19例患者的19份玻璃体标本进行MGS检测。患者中男性8例, 女性11例, 年龄19~68岁;右眼10例, 左眼8例, 双眼1例;临床诊断急性视网膜坏死8例(9只眼), 诊断不明11例(11只眼)。每份标本留取玻璃体约1 ml, 800 μl标本用于MGS, 200 μl标本用于实时荧光定量PCR的验证实验。MGS使用TIANamp Micro DNA Kit试剂盒提取样本DNA, BGISEQ-500平台测序。将测序数据中低质量和长度小于35 bp的数据、人类参考基因组序列及低复杂度序列去除后, 获得的数据与专用微生物数据库比对分析, 通过统计对比序列数占比、唯一序列数、覆盖率、测序深度等参数确定测序阳性结果, 使用实时荧光定量PCR方法对上述结果准确性进行验证。结果 19份标本MGS检出多种微生物, 7份测序结果为阳性。其中3份为水痘-带状疱疹病毒、2份为白念珠菌、1份为痤疮丙酸杆菌、1份为副流感嗜血杆菌。3份水痘-带...

关 键 词:葡萄膜炎  宏基因组学  高通量核苷酸序列分析  临床实验室技术
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