合肥市71例麻疹病例麻疹病毒基因型分析

摘要:目的 掌握合肥市2012-2013年71例麻疹病例麻疹病毒流行特征及其基因分型。方法 应用病原分子学逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)，检测麻疹IgM抗体阳性麻疹病例咽拭子样本。扩增麻疹病毒N基因COOH末端的634个核苷酸片段，扩增产物纯化后测序，基因分析采用 MEGA 5.03软件。结果 2012、2013年麻疹病例麻疹病毒基因分析分别为8、63例，合计71例，RT-PCR扩增阳性麻疹毒株分别为2、23株，合计25株，研究分析均为H1a基因亚型。基因序列分析显示25株麻疹毒株分为2条传播主链，核苷酸平均变异为0%~2.4%(核苷酸差异0~11 bp)。25株麻疹毒株与Chin9322/H1a参考株核苷酸变异0.4%~1.6%(核苷酸差异2~6 bp)，与S191疫苗株核苷酸变异7.6%~8.7%(核苷酸差异34~39 bp)。结论 H1a基因亚型是合肥市近年来麻疹传播流行优势毒株，毒株之间遗传变异程度小同源性高。

Genotyping of measles virus among 71 measles patients in Hefei City