| rDNA部分序列在食用菌进化关系研究中的应用 |
| |
| 引用本文： | 黄龙花,杨小兵,胡惠萍,张菊梅,吴清平. rDNA部分序列在食用菌进化关系研究中的应用[J]. 中国卫生检验杂志, 2011, 0(7) |
| |
| 作者姓名： | 黄龙花 杨小兵 胡惠萍 张菊梅 吴清平 |
| |
| 作者单位： | 广东粤微食用菌技术有限公司;广东省微生物研究所广东省菌种保藏与应用重点实验室; |
| |
| 基金项目： | 广东省中国科学院全面战略合作项目(2009B091300141); 广州市科技计划项目(2010Z1-E261) |
| |
| 摘 要： | 目的:建立用rDNA序列分析对食用菌的菌种进行快速分类鉴定的分子技术方法。方法:对香菇、草菇、平菇等十五种常见栽培食用菌的30个菌株的18S rDNA及ITS序列进行测序分析,用NJ(neighbor-joining)法构建系统发育树。结果:由18S rDNA序列构建的系统发育树表明:常见栽培食用菌菌种的门间相似性≥94.2%,纲间相似性≥98.3%,目间相似性≥98.5%,科、属、种间的相似性都极高,在发育树图上亲缘关系近的属种会聚在同一分支。由ITS序列构建的系统发育树表明:常见栽培食用菌菌种的ITS序列在科、属、种水平上的聚类可信度高且易于鉴定区分,侧耳科内香菇属和侧耳属相似性为88%;蛹虫草和冬虫夏草相似性为91%;侧耳属内种间相似性≥99.5%,可信度为99%;香菇种内相似性接近100%,但仍存在细微的碱基差异。结论:本研究首次将18S rDNA和ITS两个目标片段结合分析,对常见栽培食用菌的进化关系进行研究,结果表明rDNA序列分析在食用菌的菌种分类鉴定上是一种快捷有效的方法。
|
| 关 键 词： | 18S rDNA ITS 食用菌菌种 进化关系 鉴定 |
Application of rDNA partial sequences in studies of edible fungi evolution |
| |
| HUANG Long-Hua,,YANG Xiao-Bing,HU Hui-Ping,ZHANG Ju-Mei,WU Qing-Ping. Application of rDNA partial sequences in studies of edible fungi evolution[J]. Chinses Journal of Health Laboratory Technology, 2011, 0(7) |
| |
| Authors: | HUANG Long-Hua YANG Xiao-Bing HU Hui-Ping ZHANG Ju-Mei WU Qing-Ping |
| |
| Affiliation: | HUANG Long-Hua1,2,YANG Xiao-Bing2,HU Hui-Ping2,ZHANG Ju-Mei2,WU Qing-Ping2(1.Guangdong Yuewei Edible Fungi Technology Co.,Ltd.,Guangzhou 510070,China,2.Guangdong Institute of Microbiology,Guangdong Provincial Key Laboratory of Microbial Culture Collection and Application,China) |
| |
| Abstract: | Objective:To set up a rapid Molecular Biology method based on rDNA sequences analysis for identification of edible fungi.Methods:18S rDNA and ITS sequence analysis of thirty experimental strains from 15 kinds of common cultivated edible fungi,such as Lentinula edodes,Volvariella volvacea,Pleurotus spp.,etc,were investigated in this study.Results:Phylogenetic tree of the 18S rDNA and ITS sequences was also constructed by using NJ(neighbor-joining).Phylogenetic tree of the 18S rDNA sequences shows that the ho... |
| |
| Keywords: | 18S rDNA ITS Edible fungus Evolution relationship Identification |
| 本文献已被 CNKI 等数据库收录！ |
|
