| 阿瓦朗病毒和休斯病毒实时荧光RT-PCR检测方法研究 |
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| 引用本文： | 杜珊珊,李阿茜,黄晓霞,刘洋,王芹,李川,梁米芳,李德新,王世文,李建东. 阿瓦朗病毒和休斯病毒实时荧光RT-PCR检测方法研究[J]. 中华实验和临床病毒学杂志, 2021, 0(1): 111-115 |
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| 作者姓名： | 杜珊珊 李阿茜 黄晓霞 刘洋 王芹 李川 梁米芳 李德新 王世文 李建东 |
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| 作者单位： | 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所 |
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| 基金项目： | 国家科技重大专项(2018ZX10711001,2018ZX10101-002,2016ZX10004222-002)。 |
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| 摘 要： | 目的建立可以检测阿瓦朗病毒(Avalon virus,AVAV)和休斯病毒(Hughes virus,HUGV)两种内罗病毒的实时荧光定量RT-PCR检测方法,并进行初步的评价。方法收集、整理、比对、分析在公共数据库发布的两种病毒基因组核苷酸序列,确定检测靶标,设计特异性引物、探针,优化检测程序,建立实时荧光定量RT-PCR检测方法。利用体外转录技术制备的模拟样本、其他病毒感染标本、病毒株和正常人血标本比较评价所建方法的检测限、特异性、重复性特征。结果所建实时荧光定量RT-PCR检测方法可有效扩增检测AVAV和HUGA靶标RNA,检测限分别约为20拷贝/μl和70拷贝/μl,检测科萨努尔森林病毒、乙型流感病毒BV和BY型、甲型流感病毒H3N2、黄热病毒、乙型脑炎病毒、克里米亚-刚果出血热病毒、发热伴血小板减少综合征、内罗毕羊病毒和塔西那病毒样本无非特异性扩增,两种内罗病毒相互间无交叉反应,重复性比较分析显示变异系数小于2%。结论本研究建立的检测AVAV和HUGV的实时荧光定量RT-PCR方法,可用于临床样本检测和媒介生物、宿主动物标本筛查,便于病原的快速识别和疾病诊断。
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| 关 键 词： | 内罗病毒 实时荧光RT-PCR 阿瓦朗病毒 休斯病毒 |
Real-time fluorescent quantitative RT-PCR methods for detection of Avalon virus and Hughes virus |
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| Du Shanshan,Li Aqian,Huang Xiaoxia,Liu Yang,Wang Qin,Li Chuan,Liang Mifang,Li Dexin,Wang Shiwen,Li Jiandong. Real-time fluorescent quantitative RT-PCR methods for detection of Avalon virus and Hughes virus[J]. Chinese journal of experimental and clinical virology, 2021, 0(1): 111-115 |
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| Authors: | Du Shanshan Li Aqian Huang Xiaoxia Liu Yang Wang Qin Li Chuan Liang Mifang Li Dexin Wang Shiwen Li Jiandong |
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| Affiliation: | (Key Laboratory of Biosafety,National Health and Family Planning Commission,National Institute for Viral Disease Control and Prevention,Chinese Center for Disease Control and Prevention,Beijing 102206,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Nairoviruses Quantitative real-time PCR Avalon virus Hughes virus |
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