| 基因芯片表达谱筛选Kaposi肉瘤相关基因 |
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| 引用本文： | 王慧,吕国栋,王晓东,惠艳,刘辉,林仁勇,王星. 基因芯片表达谱筛选Kaposi肉瘤相关基因[J]. 中华皮肤科杂志, 2011, 44(6): 403-406. DOI: 10.3760/cma.j.issn.0412-4030.2011.06.008 |
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| 作者姓名： | 王慧 吕国栋 王晓东 惠艳 刘辉 林仁勇 王星 |
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| 作者单位： | 1. 新疆医科大学第一附属医院2. 3. 新疆医科大学第一附属医院皮肤科4. 乌鲁木齐市新疆医科大学第一附属医院5. 新疆医科大学第一附属医院医学研究中心 |
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| 基金项目： | 新疆维吾尔自治区自然科学基金，新疆医科大学第一附属医院青年科研专项基金 |
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| 摘 要： | 目的 筛选Kaposi肉瘤相关基因。 方法 新疆本地1例经典型Kaposi肉瘤患者，提取病灶组织及正常皮肤组织的总RNA，逆转录成 cDNA，采用实时荧光定量PCR（RT-qPCR）的方法检测Kaposi肉瘤相关疱疹病毒（Kaposi sarcoma-associated herpersivirus，KSHV）基因K8.1、K2、ORF50在组织中的表达来确定所取标本有无交叉污染。随后进行荧光标记制备探针，与含有25100条人类基因的35K cDNA基因表达谱芯片进行杂交，用扫描仪扫描芯片荧光信号图像，并用软件对扫描图像进行数字化处理和分析。结果 RT-qPCR检测到 KSHV基因在Kaposi肉瘤病灶组织中的存在，而正常皮肤组织中未检测到，说明样本取材无交叉污染。在25 100个基因中，共有1313条差异基因，其中756条基因表达上调，557条基因表达下调。差异表达显著的基因涉及细胞凋亡、血管发生、细胞信号传导、蛋白加工和细胞周期调节等，如髓样细胞白血病-1基因（MCI-1）、膜联蛋白基因、丝氨酸蛋白酶抑制剂（SPINK5）基因等。结论 MCI-1、SPINK5等基因可能与Kaposi肉瘤的发病有关联。
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| 关 键 词： | 差异表达基因 |
| 收稿时间： | 2010-08-18 |
Screening for Kaposi sarcoma-associated genes by using Genechip technology |
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| WANG Hui,LV Guo-dong,WANG Xiao-dong,HUI Yan,LIU Hui,LIN Ren-yong,WANG Xing. Screening for Kaposi sarcoma-associated genes by using Genechip technology[J]. Chinese Journal of Dermatology, 2011, 44(6): 403-406. DOI: 10.3760/cma.j.issn.0412-4030.2011.06.008 |
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| Authors: | WANG Hui LV Guo-dong WANG Xiao-dong HUI Yan LIU Hui LIN Ren-yong WANG Xing |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Sarcoma,Kaposi Oligonucleotide array sequence analysis Gene expression profiling Differential expression gene |
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