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三七合剂干预肝缺血再灌注损伤机制的网络药理学探讨
引用本文:韩根利,刘宏胜. 三七合剂干预肝缺血再灌注损伤机制的网络药理学探讨[J]. 中草药, 2020, 51(20): 5260-5269
作者姓名:韩根利  刘宏胜
作者单位:天津市第一中心医院药学部, 天津 300192;天津市第一中心医院国家卫生健康委员会危重病急救医学重点实验室, 天津 300192
基金项目:天津市第一中心医院春风课题(2019CF15)
摘    要:目的通过网络药理学构建三七合剂的活性成分-肝缺血再灌注损伤(hepatic ischemia-reperfusion injury,HIRI)靶点-生物通路的网络关系,探讨三七合剂干预HIRI的关键靶点及作用机制。方法通过国内外文献调研和中药系统药理学分析平台(TCMSP)及Pharm Mapper、Swiss Target Prediction等服务器,以口服利用度(OB)和类药性(DL)作为限定条件筛选并收集三七合剂干预HIRI的相关靶点;利用OMIM数据库筛选并整理HIRI相关的基因和蛋白靶点。利用Excel表合并、整理成分与疾病靶点的交集,通过Cytoscape3.7.2软件的插件Network Analyzer分析,以拓扑参数度(degree)≥5(平均自由度为4.5)为筛选条件找到核心靶点,并将交集靶点导入STRING服务器,并以置信度得分(Confidence Score)≥0.85为筛选条件构建核心蛋白互作(Hub-PPI)网络;将交集靶点导入FunRich 3.0软件进行生物学过程和生物学通路分析,利用Cytoscape3.7.2构建中药-活性成分-HIRI靶点-生物学通路网络。结果三七合剂能降低HIRI小鼠天门冬氨酸转氨酶(AST)及谷氨酸转氨酶(ALT)的表达(P0.01);三七合剂经筛选得到45个活性成分,对应靶点3 273个,主要化合物包括熊果酸、齐墩果酸、马钱子苷、槲皮素、人参皂苷F2、芍药苷等;整理HIRI得到196个靶点,其与成分的交集靶点为46个,主要包括11-β-羟类固醇脱氢酶(HSD11B1)、腺苷受体A3(ADORA3)、环氧化酶2(PTGS2)、腺苷受体A1(ADORA1)、蛋白激酶C-ε(PKCε)等;经STRING服务器设定ConfidenceScore≥0.85的限定条件,得到高置信度PPI网络并经cluster处理将其聚为3类;经FunRich软件分析得到蛋白质代谢作用、信号传导、酶活性的负调控、炎症反应、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号通路共5条生物学过程(P0.05);整合素连接激酶信号、TNF受体信号通路、p38丝裂原活化蛋白激酶信号通路、TRAIL信号通路等16条生物通路(P0.01)。结论初步探讨了三七合剂干预HIRI是通过多成分和多靶点的相互作用,及调控多条生物通路及生物学过程共同完成的,但关键的核心靶标和具体的调控机制尚待进一步的实验验证。

关 键 词:三七  山茱萸  白芍  三七合剂  网络药理学  生物通路  数据库  靶点  肝缺血再灌注损伤  熊果酸  齐墩果酸  马钱子苷  槲皮素  人参皂苷F2  芍药苷
收稿时间:2020-02-27

Mechanism of Sanqi Mixture for intervention in hepatic ischemia reperfusion injury based on network pharmacology
HAN Gen-li,LIU Hong-sheng. Mechanism of Sanqi Mixture for intervention in hepatic ischemia reperfusion injury based on network pharmacology[J]. Chinese Traditional and Herbal Drugs, 2020, 51(20): 5260-5269
Authors:HAN Gen-li  LIU Hong-sheng
Affiliation:Department of Pharmacy, Tianjin First Center Hospital, Tianjin 300192, China; NHC Key Laboratory of Critical Care Medicine, Tianjin First Center Hospital, Tianjin 300192, China
Abstract:
Keywords:Panax notoginseng (Burk.) F. H. Chen  Cornus officinalis Sieb. et Zucc.  Paeonia lactiflora Pall.  Sanqi Mixture  network pharmacology  biological pathways  database  target  hepatic ischemia reperfusion injury  ursolic acid  oleanolic acid  brucine  quercetin  ginsenoside F2  paeoniflorin
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