| 三七PnUGT1基因的全长cDNA克隆和生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 向丽,郭溆,牛云云,陈士林,罗红梅.三七PnUGT1基因的全长cDNA克隆和生物信息学分析[J].药学学报,2012(8):1085-1091. |
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| 作者姓名： | 向丽 郭溆 牛云云 陈士林 罗红梅 |
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| 作者单位： | 中国医学科学院、北京协和医学院药用植物研究所,濒危药材繁育国家工程实验室 |
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| 基金项目： | 人事部留学人员择优资助项目(2009-101);教育部长江学者创新团队发展计划(2012) |
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| 摘 要： | 本研究通过对三七的转录组高通量测序结果进行分析,采用5’-RACE和RT-PCR方法,对其中一条可能参与三萜皂苷合成的UDP-糖基转移酶基因转录本(Pn02086)进行全长克隆,预测了该基因编码蛋白的理化性质、保守结构域等,并对其进行了进化分析。通过全长克隆,得到一条开放阅读框为1 488 bp的cDNA序列,命名为PnUGT1,GenBank登录号JX018210。该基因编码495个氨基酸,蛋白分子量为55.453 kD,属于不稳定蛋白。二级结构中α-螺旋占36.16%、β-折叠占11.31%、无规卷曲占52.53%。InterProScan预测该蛋白具有7个保守结构域,包括在植物次生代谢产物中相关糖基转移酶特有的PSPG保守基序。该蛋白不具有信号肽和跨膜区,最有可能定位在细胞质中。序列比对和进化关系分析表明,该蛋白和蒺藜苜蓿三萜合成相关的UDP-糖基转移酶AAW56092的亲缘关系较近,PSPG保守区域的相似性为66%。该基因在三七叶中表达量较在花、茎和根中的表达量高。推测PnUGT1基因可能参与了三七皂苷的合成。
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| 关 键 词： | 三七 UDP-糖基转移酶 三萜皂苷 次生代谢 |
Full-length cDNA cloning and bioinformatics analysis of PnUGT1 gene in Panax notoginseng |
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| XIANG Li,GUO Xu,NIU Yun-yun,CHEN Shi-lin,LUO Hong-mei.Full-length cDNA cloning and bioinformatics analysis of PnUGT1 gene in Panax notoginseng[J].Acta Pharmaceutica Sinica,2012(8):1085-1091. |
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| Authors: | XIANG Li GUO Xu NIU Yun-yun CHEN Shi-lin LUO Hong-mei |
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| Institution: | (National Engineering Laboratory for Breeding of Endangered Medicinal Materials,Institute of Medicinal Plant Development,Chinese Academy of Medical Sciences & Peking Union Medical College,Beijing 100193,China) |
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