中国HCV5′-非编码区复合酶切分型及其3b基因型序列分析 |
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引用本文: | 杜绍财,孙南雄,范晓峰,邱国华,尤鹏,张永祥,魏来.中国HCV5′-非编码区复合酶切分型及其3b基因型序列分析[J].中华检验医学杂志,2004(10). |
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作者姓名: | 杜绍财 孙南雄 范晓峰 邱国华 尤鹏 张永祥 魏来 |
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作者单位: | 北京大学人民医院肝病研究所,南京医科大学第一附属医院传染病研究室,美国SaintLouis大学内科学胃肠与肝病科病毒性肝炎研究中心,北京大学人民医院肝病研究所,北京大学人民医院肝病研究所,南京医科大学第一附属医院传染病研究室,北京大学人民医院肝病研究所 100044,100044,100044,100044 |
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基金项目: | 国家“十五”科技攻关计划资助项目 ( 2 0 0 1BA70 5B0 6) |
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摘 要: | 目的 研究中国丙型肝炎病毒 (HCV)不同基因型感染分布情况 ,并对 3b序列进行分析。方法 采用逆转录 聚合酶链反应 (RT PCR)技术扩增HCV5’NCR 1a、1b、2a、2b、3a、3b、4a、6a不同基因型的cDNA及 187份HCVRNA阳性样品中cDNA。A应用BHH (BsrBI、HaeⅡ、HinfI)复合内切酶消化 5′ NCRcDNA ,B应用BstUⅠ消化 ,C应用HaeⅢ消化 ,电泳检测片段大小。结果 187例HCVRNA阳性患者ABC分型结果表明 ,1b型感染率占 6 7 38% ,2a型 12 30 % ,1b/ 2a型为5 88% ,3b型 5 35 % ,2b型 3 2 1% ,2a/ 2b、1b/ 2b型各为 2 14 % ,1a型 1 0 7,6a型 0 5 4 %。 3份 3b基因型 5’ NCRA T克隆测序结果表明 ,3株 3b型之间同源性为 99 5 4 %~ 10 0 %。其中chiKQ5 0与GI5 14 395 3a株为 96 2 8%与GI6 76 8773b株同源性为 98 6 % ,与 1a型为 93 4 9% ,与 1b型为94 88% ,与 2a型为 91 6 3% ,与 2b型为 89 30 % ,与 4a型为 95 35 % ,与 6a型为 93 4 % ,结论 研究结果表明该项分型技术既保证了RT PCR检测灵敏度 ,又具有良好的分型效果。提示 :该分型方法不仅适合中国HCV基因型检测 ,对亚洲及欧洲和非洲HCV分型研究也具有一定的参考价值
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关 键 词: | C型肝炎样病毒属 基因型 聚合酶链反应 |
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