| 应用基因芯片分析结核分枝杆菌常见耐药基因型的研究 |
| |
| 引用本文： | 吴雪琼,张琼,张俊仙,梁建琴,鲁红丽,李洪敏,张洪恩,陆阳,荣利,吕翠环,张广宇,邢婉丽.应用基因芯片分析结核分枝杆菌常见耐药基因型的研究[J].中国防痨杂志,2006,28(1):4-10. |
| |
| 作者姓名： | 吴雪琼 张琼 张俊仙 梁建琴 鲁红丽 李洪敏 张洪恩 陆阳 荣利 吕翠环 张广宇 邢婉丽 |
| |
| 作者单位： | [1]解放军第309医院结核病中心研究室,北京100091 [2]生物芯片北京国家工程研究中心,北京102206 [3]河北省胸科医院,石家庄050041 |
| |
| 基金项目： | 本课题为“十五”国家重大科技专项“功能基因组和生物芯片”科研基金和军队医学杰出中青年人才科研基金项目（01J020）： |
| |
| 摘 要： | 目的应用基因芯片快速检测结核分枝杆菌耐药基因型，建立一种新的分子药敏试验方法。方法以传统药敏试验和PCR－直接测序方法为对照，应用基因芯片快速检测157株结核分枝杆菌临床分离株异烟肼（INH）、利福平（RFP）、链霉素（SM）和乙胺丁醇（EMB）耐药基因（katG、rpoB、rpaL、rrs和embB）的带荧光素标记的PCR产物。结果PCR-直接测序和基因芯片检测36株结核分枝杆菌药物敏感株的5种耐药基因均为野生型。121株结核分枝杆菌耐药分离株中，56株耐INH分离株，katG基因突变率为62．5％，其中katG缺失率为7．5％，315位密码子突变率为55．4％，279位密码子突变率为1．8％；104株耐RFP株，rpoB基因突变率为94．2％，最常见的突变位点为531位和526位密码子（突变率分别为60．6％、15．4％），双位点突变率为5．8％，还发现511、513、515、516、517、518和533位密码子突变；62株耐SM分离株，rpsL和ITS总突变率为88．7％（两者分别为82．3％、6．5％），rpsL突变位于43位和88位密码子（突变率分别为77．4％、4．8％），rrs突变位于513位和516位碱基（突变分别为4．8％、1．6％）；57株为耐EMB株，embB基因突变率为61．4％，均为306位密码子突变，最常见的突变为ATG→GTG或剐rA（突变率分别为35．1％、15．8％），还发现306位密码子ATG→ATC、ATT和CTG突变。通过基因芯片检出的突变与基因测序结果一致。结论应用基因芯片可分析大多数结核分枝杆菌耐药基因型，弥补传统药敏试验方法的不足，指导临床治疗。
|
| 关 键 词： | 基因芯片 耐药基因型 聚合酶链反应 分枝杆菌 结核 |
| 收稿时间： | 2005-08-02 |
| 修稿时间： | 2005-08-02 |
Identification of drug-resistant gene type in Mycobacterium tuberculosis by PCR- oligonucleotide microchlps |
| |
| Wu Xueqiong, Zhang Qiong , Zhang Junxian,et al..Identification of drug-resistant gene type in Mycobacterium tuberculosis by PCR- oligonucleotide microchlps[J].The Journal of The Chinese Antituberculosis Association,2006,28(1):4-10. |
| |
| Authors: | Wu Xueqiong Zhang Qiong Zhang Junxian |
| |
| Institution: | 1. Tuberculosis Research Laboratory, Tuberculosis Center, the 309 th Hospital of PLA, Beijing 100091, China |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | |
| 本文献已被 维普 等数据库收录！ |
|
