慢性儿童免疫性血小板减少症差异表达基因的生物信息学分析

目的:探究慢性儿童免疫性血小板减少症(ITP)的关键基因和信号通路,为研究慢性ITP的潜在分子机制提供新的思路。方法:从GEO数据库获得mRNA表达芯片数据集GSE46922,利用GEO2R筛选出DEGs,并利用DAVID对DEGs进行GO功能富集分析和KEGG信号转导通路富集分析。随后,构建PPI蛋白互作网络,筛选核心靶标。结果:筛选出274个表达上调基因,主要参与细胞骨架组构,基于肌动蛋白丝的过程,肌动蛋白纤维组织等生物过程。筛选出496个表达下调基因,主要参与动作电位和肌肉收缩等过程。KEGG分析发现,上调基因主要参与HIF-1信号通路。下调基因主要涉及焦点黏附、Rap1信号通路、PI3K-Akt信号通路、神经信号传递通路、肌动蛋白细胞骨架调控等信号通路。获得11个核心靶标:VEGFA,CCND1,ESR1,MYH14,ERBB2,CDKN3,PVALB,CDC20,CHEK1,MTOR和CFTR。结论:本研究通过生物信息学分析获得慢性ITP的关键基因和信号通路,为研究慢性ITP的发病机制提供了新的思路。核心靶标基因可作为诊断和预后评估的生物标志物。