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抑制性消减杂交技术筛选NS5ATP13 蛋白的上调基因
引用本文:党晓燕,成军,邓红,王建军,王春花,纪冬,张黎颖. 抑制性消减杂交技术筛选NS5ATP13 蛋白的上调基因[J]. 胃肠病学和肝病学杂志, 2004, 13(1): 39-42
作者姓名:党晓燕  成军  邓红  王建军  王春花  纪冬  张黎颖
作者单位:100039,北京,解放军第302医院传染病研究所基因治疗研究中心
摘    要:目的 应用抑制性消减杂交(SSH)技术构建丙型肝炎病毒(HCV)NS5ATP13蛋白反式激活相关基因差异表达的cDNA消减文库,克隆HCV NS5ATP13蛋白反式激活靶基因。方法 以HCV NS5ATP13表达质粒pcDNA3.1(-)-NS5ATPl3转染HepG2细胞,以空载体pcDNA3.1(-)为对照;制备转染后的细胞裂解液,从中提取mRNA并合成cDNA,经RsaⅠ酶切后将实验组cDNA分成两组,分别与两种不同的接头衔接,再与对照组cDNA进行两次消减杂交及两次抑制性PCR,将产物与T/A载体连接,构建cDNA消减文库,并转染大肠杆菌进行文库扩增,随机挑选克隆PCR后进行测序及同源性分析。结果 成功构建人HCV-NS5ATPl3蛋白反式激活相关基因差异表达的cDNA消减文库。文库扩增后得到102个白色克隆,进行菌落PCR分析,其中96个均得到100~1000bp插入片段。挑取40个插入片段测序分析,其中2个cDNA片段为未知序列,通过生物信息学分析获得其全长序列,已被GenBank收录,另有34个为已知功能序列。结论成功筛选出2个新的cDNA序列,并获得其全长序列,可能为HCV NS5ATPl3蛋白反式激活相关靶基因。

关 键 词:抑制性消减杂交技术 NS5ATP13蛋白 反式激活相关基因 cDNA消减文库 生物信息学 丙型肝炎病毒
修稿时间:2003-12-10

Screening and cloning of the target genes up-regulated by human gene 13 transactivated by nonstructural protein 5A of hepatitis C virus using suppression subtractive hybridization technique
DANG Xiaoyan,CHENG Jun,DENG Hong,et al Gene Therapy Research Center. Screening and cloning of the target genes up-regulated by human gene 13 transactivated by nonstructural protein 5A of hepatitis C virus using suppression subtractive hybridization technique[J]. Chinese Journal of Gastroenterology and Hepatology, 2004, 13(1): 39-42
Authors:DANG Xiaoyan  CHENG Jun  DENG Hong  et al Gene Therapy Research Center
Affiliation:DANG Xiaoyan,CHENG Jun,DENG Hong,et al Gene Therapy Research Center,Institute of Infectious Diseases,The 302 Hospital of PLA,Beijing 100039,China
Abstract:
Keywords:HCV NS5A protein  Transactivation  Subtractive hybridization
本文献已被 CNKI 维普 万方数据 等数据库收录!
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