| 西洋参PqERF1基因的克隆和生物信息学分析 |
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| 作者姓名： | Sun YZ Niu YY Li Y Zhu YJ Luo HM Chen SL |
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| 作者单位： | 中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所; |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(30873459) |
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| 摘 要： | 乙烯响应因子(ethylene response factor,ERF)是具有PETALA2(AP2)结构域的转录因子。本研究通过西洋参(Panax quinquefolius L)的转录组高通量测序结果分析获得75条具有AP2结构域的转录因子序列,并克隆到一条开放阅读框为933对碱基的基因序列,定名为PqERF1。基因表达分析结果表明PqERF1基因受茉莉酸甲酯(MeJA)的诱导,这与人参皂苷含量的受诱导模式相同。蛋白结构预测结果表明PqERF1是定位于细胞核的具有完整保守的AP2结构域的转录因子,InterproScan蛋白功能结构域分析结果表明PqERF1很可能为发病机制相关蛋白;序列比对和进化关系分析结果也显示PqERF1与发病机制相关蛋白(烟草NtERF4)、次生代谢产物相关合成蛋白(野胡萝卜DcERF1)和花衰老相关蛋白(矮牵牛PhERF12)的相似性高,且系统进化关系较近。因此,推测PqERF1基因可能是参与西洋参次生代谢产物合成调节、抗病性和衰老相关的重要基因。
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| 关 键 词： | 西洋参 乙烯响应因子 实时荧光定量PCR 次生代谢 植物防御 |
Cloning and bioinformatic analysis of PqERF1 gene in Panax quinquefolius |
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| Sun YZ,Niu YY,Li Y,Zhu YJ,Luo HM,Chen SL.Cloning and bioinformatic analysis of PqERF1 gene in Panax quinquefolius[J].Acta Pharmaceutica Sinica,2011,46(8):1008-1014. |
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| Authors: | Sun Yong-Zhen Niu Yun-Yun Li Ying Zhu Ying-Jie Luo Hong-Mei Chen Shi-Lin |
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| Institution: | SUN Yong-zhen,NIU Yun-yun,LI Ying,ZHU Ying-jie,LUO Hong-mei,CHEN Shi-lin(Institute of Medicinal Plant Development,Chinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical College,Beijing 100193,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Panax quinquefolius ethylene response factor real-time PCR secondary metabolism plant defense |
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