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口腔鳞癌中缺氧基因相关预后模型的构建与验证
作者姓名:梁丹  卢浩
作者单位:1. 复旦大学附属中山医院口腔科;2. 上海交通大学医学院附属第九人民医院口腔颌面-头颈肿瘤科
基金项目:上海市青年科技扬帆计划资助(编号:20YF1423300);
摘    要:目的:通过生物信息学筛选并建立与口腔鳞状细胞癌(OSCC)患者预后相关的缺氧基因预后模型。方法:通过癌症基因组图谱(TCGA)和GEO数据库下载OSCC患者的mRNA表达谱、临床数据和预后信息;通过蛋白互作网络(PPI)、Cox回归分析筛选和建立缺氧基因预后模型;生存分析(Kaplan-Meier, K-M)和受试者工作特征曲线(ROC)检验预后模型的准确性,单因素和多因素Cox回归评估模型作为独立预后因素的可行性;免疫相关性分析筛选差异表达的免疫检查点基因。结果:通过Cox回归分析构建了基于SLC2A3、GPI、PGK1三个缺氧基因的预后模型,将OSCC患者分为高风险组(n=173)、低风险组(n=172)。TCGA数据库中K-M生存曲线显示高风险组患者的生存率(OS)明显低于低风险组患者(P<0.001),患者1、 3、 5年ROC曲线下面积分别为0.626, 0.677和0.713; GEO数据库中K-M生存曲线显示高风险组患者的生存率(OS)明显低于低风险组患者(P=0.023),患者1、 3、 5年ROC曲线下面积分别为0.683、 0.705和0.690;单因素和多因...

关 键 词:口腔鳞状细胞癌  缺氧基因  预后模型  免疫治疗
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