焦磷酸测序检测TERT启动子突变方法的建立及其在脑胶质瘤中的应用题录

目的建立端粒酶反转录酶(TERT)启动子突变的焦磷酸测序方法, 验证其用于脑胶质瘤的可行性。方法以TERT启动子野生型和突变型质粒为参考标准品, 混和为待测核酸样本(预设突变率分别为0%、5%、10%、25%、50%和100%);采用焦磷酸测序方法进行检测, 以3次检测均值作为检测突变率。采用Pearson相关分析法进行检测突变率与预设突变率的相关性分析。收集2020年4—6月由北京市神经外科研究所分子病理室诊断为脑胶质瘤的120例患者的甲醛固定石蜡包埋(FFPE)切片样本;其中40例经二代测序检测, TERT启动子野生型17例, C228T突变型19例, C250T突变型4例。对120例样本进行扩增和焦磷酸测序, 检测TERT启动子突变情况;计算不同病理类型脑胶质瘤患者中TERT启动子突变率, 即突变型/(野生型+突变型)。采用Kappa一致性检验法比较40例样本的焦磷酸测序结果与二代测序结果。结果 TERT启动子标准品检测结果显示, 碱基检测峰的位置及峰高清晰, 碱基单峰信号值均超过30;相关性分析结果显示, C228T和C250T的检测突变率与样本预设突变率呈线性正相关(Y=0....