曼氏迭宫绦虫annexinB8的生物信息学分析和基因克隆

目的：通过生物信息学预测曼氏迭宫绦虫 annexinB8（SmannexinB8）的生物学特征，及潜在功能和结构，并且进行基因克隆，为下一步SmannexinB8参与宿主免疫调节研究提供依据。方法通过NCBI的ORF finder工具对SmannexinB8的开放阅读框进行分析，利用ExPASy 网站进行蛋白的物理化学参数、信号肽、跨膜螺旋、潜在分子生物学功能的预测，通过NCBI／BLAST 对蛋白保守功能域进行检测。不同物种的annexin序列从NCBI网站获取，并利用Vector NTI suit 8.0和 TreeView 软件进行分析。利用 SWISS-MODEL 网站和 SPDBV 4.10软件分析 SmannexinB8蛋白的三维空间结构。此外，对SmannexinB8基因进行扩增，并克隆到原核表达载体 pET-28a （＋）。结果 SmannexinB8是一个全长基因，编码347个氨基酸。蛋白由4个典型的annexin重复结构域组成，序列当中没有信号肽，是一个稳定的可溶性蛋白分子。三维空间立体结构分析结果显示SmannexinB8是一个保守的蛋白。SmannexinB8与多房棘球绦虫、口膜壳绦虫、细粒棘球绦虫、华支睾吸虫以及人类的annexin 基因的同源性分别是68％，67％，65％，46％和40％。分子进化分析显示SmannexinB8与绦虫属的亲源性最近，而与其他物种，如吸虫、哺乳动物亲源性较远。结论 SmannexinB8可能具有抑制磷脂酶A2的活性，促进细胞融合、参与调节免疫反应和离子通道形成的功能，可能在参与宿主免疫调节中起到关键性的作用。

Sequence bioinformatics analysis and gene cloning of annexinB8 from Spirometra mansoni