铁死亡对压疮的调控机制:生物信息学分析及实验结果验证 |
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作者姓名: | 唐路路 潘晓佳 赖英桃 王力 |
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作者单位: | 1. 广州中医药大学第一临床医学院;2. 广州中医药大学第一附属医院;3. 广州中医药大学基础医学院 |
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摘 要: | 背景:铁死亡介导的缺血再灌注损伤对压疮的发生发展起重要作用,可能存在压疮相关的铁死亡生物标志物,但其机制尚未阐明。目的:通过生物信息学手段探讨压疮的分子机制,寻找压疮过程中铁死亡相关差异基因,为其临床治疗提供新的视角。方法:使用GEO数据库和FerrDb数据库下载数据集并进行预处理。对单细胞转录组测序数据进行聚类和占比分析、代谢活性和拟时序分析、细胞通讯分析、铁死亡基因集细胞识别和富集分析,确定铁死亡差异基因,并通过动物实验进一步验证。将20只SD大鼠随机分为正常组和模型组,每组10只。正常组大鼠不进行任何处理,模型组大鼠采用缺血再灌注循环周期模式制备压疮大鼠模型,采用荧光定量PCR和免疫印迹检测压疮大鼠创面组织内差异表达基因和蛋白的变化。结果与结论:(1)单细胞转录组测序数据聚类划分为6种细胞类型,压疮组2型和3型角质形成细胞占比较高。(2)不同细胞亚群之间具有明显的代谢异质性和演变轨迹。(3)2型和3型角质形成细胞在细胞通讯中作用最强,2型角质形成细胞配体-受体强度最佳。(4)2型角质形成细胞铁死亡得分较高,有显著上调或下调的差异基因,并得到27个GO富集条目、20个KEGG富集条...
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关 键 词: | 生物信息学 单细胞转录组测序 压疮 缺血再灌注 组织损伤 慢性创面 铁死亡 氧化应激 GPX4 ACSL4 |
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