2009—2019年北京市朝阳区甲型H1N1流感病毒 HA基因特征分析

目的 分析北京市朝阳区2009—2019年甲型H1N1流感病毒(H1N1)血凝素(hemagglutinin, HA)基因特征，了解朝阳区H1N1变异情况，为评估流感疫苗有效性提供依据。方法 从GenBank数据库和GISAID平台下载2009—2019年流感疫苗推荐株以及各分支主要流行株和代表株序列，与北京市朝阳区46株H1N1北京分离株的HA基因序列进行系统进化分析和氨基酸变异分析。利用MEGA 5.0软件邻接法(neighbor-joining, NJ)构建系统进化树并查看氨基酸变异位点，同时采用NetNGlyc 1.0在线软件分析HA基因潜在的糖基化位点。结果 北京市朝阳区46株H1N1分离株HA基因分别属于Clade 7、Clade 8、6B、6B.1、6B.2及6C等分支。除2009年以外，2012—2019年H1N1北京市朝阳区分离株与对应年度疫苗株比较接近，同源性为90%以上。各年份H1N1北京市朝阳区分离株在4个抗原决定簇区均有氨基酸变异发生，近年H1N1北京市朝阳区分离株所在的6B.1分支序列均有S74R(Cb区)、S164T(Sa区)共同氨基酸变异；除了6B.1A...